scipy-cluster 自定义生成的树状图

Question

这是对Dendrogram generated by scipy-cluster does not show 的跟进。

from matplotlib.pyplot import show
from scipy.spatial.distance import pdist
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram
from numpy.random import rand

X = rand( 5, 3 )
X[0:5, :] *= 2
Y = pdist( X )
Z = linkage( Y )
dendrogram( Z )
show()

当dendrogram() 返回带有ivl, leaves, color_list, icoord 键的字典时，pyplot 正在拾取。如何在标签和叶子长度传递给pyplot 之前修改它们？

做类似的事情：

d=dendrogram( Z )
d['leaves']=['label1','label2','label3','label4','label5']

似乎没有影响。

叶子的长度应该是这样的：

Answer 1

根据dendrogram documentation，您应该能够在调用它时定义标签（通过labels 或leaf_label_func 参数）。所以没有必要在事后试图篡改标签。