Python scipy 需要 BLAS

Question

我的 python 程序中有 scipy 作为依赖项，我正在尝试使用 setuptools 进行打包。

我在 setup.py 中使用了install_requires=['scipy','matplotlib']。

正在运行python setup.py install

Processing dependencies for Bland==1.0.a.dev1
Searching for scipy
Reading http://pypi.python.org/simple/scipy/
Best match: scipy 0.13.3
Downloading https://pypi.python.org/packages/source/s/scipy/scipy-0.13.3.zip#md5=20ff3a867cc5925ef1d654aed2ff7e88
Processing scipy-0.13.3.zip

它一直持续到它显示 3 到 4 个警告和如下错误

ages/numpy/distutils/system_info.py:1522: UserWarning: 
    Atlas (http://math-atlas.sourceforge.net/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [atlas]) or by setting
    the ATLAS environment variable.
  warnings.warn(AtlasNotFoundError.__doc__)
/home/storm/Documents/bland/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/distutils/system_info.py:1531: UserWarning: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable.
  warnings.warn(BlasNotFoundError.__doc__)
/home/storm/Documents/bland/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/distutils/system_info.py:1534: UserWarning: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) sources not found.
    Directories to search for the sources can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas_src]) or by setting
    the BLAS_SRC environment variable.
  warnings.warn(BlasSrcNotFoundError.__doc__)
error: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable

我找到了this question，但这是在没有setup.py 的情况下安装 scipy，它告诉下载，然后编译 fortran 文件，最后将它们链接到一个库，然后在安装 scipy 时该库必须位于您的搜索路径中。但是我应该如何从setup.py 执行此操作，或者是否有解决方法。

仅供参考：我在virtualenv运行这个

Answer 1

据我所知，您不能使用setup.py 来安装系统库。这种机制仅适用于 Python 包及其 C 扩展（可能会定义自己对 C 共享库的依赖关系，但这不是这里的解决方案）。

您可以尝试多种解决方案，但它们都在setup.py 文件之外：

• 创建一个安装程序（RPM、DEB 或 Windows 程序包），您可以在其中定义您对 Atlas 程序包的依赖关系。然后系统包管理器（yum、apt-get、hmmm...Windows 上什么都没有）负责查找 lib 并为您的包安装它。
  • RPM: remember 你直接从setup.py 得到一个bdist_rpm 命令
  • Windows：remember 您还可以从setup.py 获得bdist_msi 命令
  • DEB：stdeb package 创建bdist_deb 命令
• 使用buildout 作为构建机制
  • 将 Atlas 定义为 part
  • 使用 cmmi 配方来下载、配置、制作和“制作安装”Atlas tarball
  • 在定义包的setup 之前，将os.environ ATLAS 变量设置为setup.py 中构建的parts 目录。
• 只需将 Atlas 列为您的包的依赖项并让您的用户安装它。将 scipy 依赖项保留在您的 setup.py 中；这是正确的地方，因为它是一个 Python 包。