java中的广义线性混合效应模型[关闭]答案

【问题标题】：Generalized linear mixed effects model in java [closed]java中的广义线性混合效应模型[关闭]
【发布时间】：2016-04-09 04:31:00
【问题描述】：

我有一个使用 glmer 方法创建广义线性混合效应模型的 R 代码，我需要将此代码移植到 java。

是否有开箱即用提供此功能的库？

我尝试了谷歌，但可以找到任何直接有用的东西。

有没有办法使用 Apache Math 库实现混合效应回归？

我还在学习混合效应模型的概念，还没有完全理解这些概念。我在这里找到了一个提供多元回归的类http://commons.apache.org/proper/commons-math/apidocs/org/apache/commons/math3/stat/regression/MultipleLinearRegression.html，我想我可以用它来实现我需要的东西。

以前有没有人尝试过做类似的事情？

【问题讨论】：

您可以使用 rJava 包从 Java 中获取简单的解决方案和接口 R。
你能提供你所说的rJava包的链接吗？
添加了一个示例作为答案。希望对你有帮助

标签： java r machine-learning statistics

【解决方案1】：

您可以使用 rJava 包。它要求机器上安装了 R，但是，它允许从 java 调用 R 代码。

要使用它，您需要先安装它install.packages('rJava')。之后，您需要将以下内容添加到 R 的目录中

<R_HOME>\bin\i386;
<R_HOME>\library\rJava\jri\i386;

在java中你需要从

添加所有的jar

<R_HOME>\library\rJava\jri

到你的类路径。

之后你可以调用 rJava

Rengine eng = new Rengine(new String[] { "--no-save" }, false, null);

String[] colNames = {"col1", "col2", "col3"};
String[] col1 = {"a1", "a2", "a3", "a4"};
String[] col2 = {"b1", "b2", "b3", "b4"};
int[] col3 = {1, 2, 3, 4};

REXP mydf = REXP
            .createDataFrame(new RList(
                    new REXP[] {
                            new REXPString(col1),
                            new REXPString(col2),
                            new REXPInteger(col3)},
                    colNames));
//generate a dataframe inr engine
eng.assign("myDataFrame", mydf);

 //Calculate MEAN of vector using R syntax.
 eng.eval("meanVal=mean(myDataFrame$col3)");

 //Retrieve MEAN value
 double mean = eng.eval("meanVal").asDouble();

【讨论】：