如何解决 PendingDeprecationWarning 的问题：矩阵子类不是表示矩阵的推荐方式答案

【问题标题】：How to solve issue of PendingDeprecationWarning: the matrix subclass is not the recommended way to represent matrices如何解决 PendingDeprecationWarning 的问题：矩阵子类不是表示矩阵的推荐方式
【发布时间】：2019-10-02 10:45:44
【问题描述】：

我将 python 代码用作我不想触摸的黑匣子。该代码在 Ubuntu 12.04 下使用 Python 运行良好，但在将系统升级到 Ubuntu 16 后，我收到以下警告，该警告会中断代码运行。知道如何在不更改代码的情况下解决此问题吗？非常感谢。

文件“/home/hammouc/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/sparse/base.py”，第 849 行，以致密 return np.asmatrix(self.toarray(order=order, out=out))

文件“/home/hammouc/.local/lib/python2.7/site-packages/numpy/matrixlib/defmatrix.py”，第 71 行，在 asmatrix 中返回矩阵（数据，dtype=dtype，copy=False）

新中的文件“/home/hammouc/.local/lib/python2.7/site-packages/numpy/matrixlib/defmatrix.py”，第 123 行 PendingDeprecationWarning, stacklevel=2)

PendingDeprecationWarning：矩阵子类不是表示矩阵或处理线性代数的推荐方法（请参阅https://docs.scipy.org/doc/numpy/user/numpy-for-matlab-users.html）。请调整您的代码以使用常规 ndarray。

【问题讨论】：

看起来像一个 scipy.sparse 矩阵 todense 正在触发这个。理想的情况是用toarray 方法调用替换它。
非常感谢这有帮助！
您使用的是哪个numpy 和scipy 版本？我知道我们不鼓励使用 np.matrix，但我不知道有任何实际的弃用趋势。
我在 np.matrixlib.defmatrix.py 文件 (1.16.3) 中发现了该警告消息。您的警告级别必须与我的不同（默认）。

标签： python-2.7 numpy matrix scipy deprecated

【解决方案1】：

这是一个未决的弃用警告。

含义：在下一个版本中，此功能将被取消，之后您将崩溃。

这是一个警告 - 目前你的代码可以工作，下次更新：谁知道？

如果您不想接触使用已弃用部分的代码，您有几个选择： - 你可以停止升级（冻结你的 Scipy 版本 - 永远不要再升级） - 您可以更改代码以使用ndarray

无论您采取什么方式，都应该在阅读 https://docs.scipy.org/doc/numpy/user/numpy-for-matlab-users.html) 并进行风险分析之后完成 - 如果您使用代码进行线性代数以降落下一个 Rover III 在 Saturn 上，您可能应该将其更改为更可靠的东西。

如果你为你的 3 株西红柿解决了“浇水”问题 - 最糟糕的事情是你买不到西红柿，你必须在商店里买它们......

【讨论】：

【解决方案2】：

使用import warnings 模块，可以控制警告的显示。

以M 作为稀疏矩阵：

In [26]: warnings.filterwarnings('ignore', category=PendingDeprecationWarning)  
In [27]: M.todense()                                                            
Out[27]: 
matrix([[1., 0., 0.],
        [0., 1., 0.],
        [0., 0., 1.]])
In [28]: warnings.filterwarnings('default', category=PendingDeprecationWarning) 
In [29]: M.todense()                                                            
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/numpy/matrixlib/defmatrix.py:71: PendingDeprecationWarning: the matrix subclass is not the recommended way to represent matrices or deal with linear algebra (see https://docs.scipy.org/doc/numpy/user/numpy-for-matlab-users.html). Please adjust your code to use regular ndarray.
  return matrix(data, dtype=dtype, copy=False)
Out[29]: 
matrix([[1., 0., 0.],
        [0., 1., 0.],
        [0., 0., 1.]])

生成ndarray 而不是np.matrix：

In [30]: M.toarray()                                                            
Out[30]: 
array([[1., 0., 0.],
       [0., 1., 0.],
       [0., 0., 1.]])
In [31]: M.A                                                                    
Out[31]: 
array([[1., 0., 0.],
       [0., 1., 0.],
       [0., 0., 1.]])

显然我的默认ipython 设置忽略了这些警告，所以我以前没有见过这个。我得看看配置文件。

【讨论】：