如何解决错误：“在 python 中使用 pymer4 库时未安装 R 包“lme4”？答案

【问题标题】：How can I solve the error: "The R package "lme4" is not installed when using the pymer4 library within python?如何解决错误：“在 python 中使用 pymer4 库时未安装 R 包“lme4”？
【发布时间】：2021-11-11 00:20:18
【问题描述】：

我正在尝试遵循此处详述的示例：Mixed effects logistic regression，但我在该行收到“PackageNotInstalledError: The R package "lme4" is not installed” results = model.fit()

数据集可以在这里下载：https://web.stanford.edu/class/archive/cs/cs109/cs109.1166/stuff/titanic.csv

我的代码是：

import os 
import pandas as pd
import statsmodels.genmod.bayes_mixed_glm as smgb
from pymer4.models import Lmer

titanic = pd.read_csv(os.path.join(os.getcwd(), 'titanic.csv'))

model = Lmer("Survived  ~ Age  + (1|Pclass)",
             data=titanic, family = 'binomial')

results = model.fit())

print (results)

Lmer 函数有效，只是当我尝试拟合模型时出现错误。我曾假设所需的软件包已包含在 pymer4.xml 中。任何有关如何安装此软件包的想法将不胜感激。

【问题讨论】：

你是如何开始安装pymer4的？
我在 conda 环境中使用了“pip install pymer4”
您是否阅读了Installation，特别是作者明确建议不要使用pip 安装的部分，以及他们提到如何与库本身一起安装必要的 R 包的部分（如果出现您上面提到的错误该怎么办）？
我修复了这个问题：conda install -c ejolly -c defaults -c conda-forge pymer4
@esqew 我建议你以后不要勉强提供帮助。但是，无论如何，感谢您在最初的评论中为我指明了正确的方向。

标签： python logistic-regression statsmodels mixed-models

【解决方案1】：

我通过使用以下方法重新安装 pymer4 解决了这个问题：

conda install -c ejolly -c defaults -c conda-forge pymer4

【讨论】：