将 Python 字典嵌套到 Pandas 数据帧

Question

我有一个嵌套的 Python 字典：

d={'CON-2': {'gene-ODF3': [2.0, 44474],'gene-SCGB1C1': [0.184937, 36615], 'gene-TRNAN-GUU-19': [32.0, 443]},'CON-1':{'gene-ODF3': [10.00, 44474], 'gene-SCGB1C1': [0.184937, 36615], 'gene-TRNAN-GUU-19': [30.0, 443], 'gene-LOC103247846': [20.0, 22111]}}

我想在散点图上绘制每个基因的 FPKM（第一个值）与其 DNA 转录本丰度（第二个值）。我尝试了一些不同的方法，例如：

CON_1=pd.DataFrame(d['CON-1'].items(),columns=['FPKM','Fraction-0'])
CON_2=pd.DataFrame(d['CON-2'].items(),columns=['FPKM','Fraction-0'])

df=pd.DataFrame.from_dict({(i,j): d[i][j]
                           for i in d.keys()
                           for j in d[i].keys()},
                           orient='index')

但我无法将这两个值分开。我想为每个条件（CON-1 和 CON-2）生成一个单独的数据框，如下所示：

gene       FPKM    DNA-abundance
gene-ODF3  2.0     44474

Answer 1

pd.DataFrame(d)['CON-1'].apply(pd.Series)\
                        .rename(columns={0:'FPKM',1:'DNA-abundance'})
#                        FPKM  DNA-abundance
#gene-ODF3          10.000000        44474.0
#gene-SCGB1C1        0.184937        36615.0
#gene-TRNAN-GUU-19  30.000000          443.0
#gene-LOC103247846  20.000000        22111.0

其他情况也一样。