【发布时间】:2021-04-25 02:16:00
【问题描述】:
我有一个大矩阵(28960×45807 Array{Float64,2}),其中行代表个体,列代表 snpID。现在我想得到一个子集矩阵(28960x4580),从大矩阵中随机选择 snps。 我如何在 Julia 中做到这一点?
【问题讨论】:
标签: julia ijulia-notebook
我有一个大矩阵(28960×45807 Array{Float64,2}),其中行代表个体,列代表 snpID。现在我想得到一个子集矩阵(28960x4580),从大矩阵中随机选择 snps。 我如何在 Julia 中做到这一点?
【问题讨论】:
标签: julia ijulia-notebook
假设你的矩阵是x:
using StatsBase
@view x[:, sample(1:size(x,2), 4580, replace=false, ordered=true)]
解释:
@view 可避免数据复制。可以在此命令中跳过它,但会降低性能:选择所有行的数据,数组切片的第二个参数用于选择一堆列size(x,2) 返回列数StatsBase 中的sample 对列号进行抽样而不进行替换。此外,我假设您不想更改列的顺序【讨论】:
axes(x, 2) 而不是1:size(x, 2)?