【发布时间】:2015-04-08 11:33:51
【问题描述】:
计算条件均值列,在ff/ffbase 包中。
我正在寻找ff/ffbase 包中的功能,它允许我进行类似于下面使用data.table 包进行的数据操作:
library(data.table)
irisdf <- as.data.table(iris)
class(irisdf)
#"ffdf"
irisdf[, NewMean:= mean(Sepal.Length), Species]
ffbase 中有一个条件均值函数,但是,它在irisdf[,5] 中创建了类数长度的向量:
condMean(x = irisdf[,1], index = irisdf[,5], na.rm = FALSE)
,而不是长度为 nrow(irisdf) 的新向量。
正如@BondedDust 建议的ave(base) 给出正确的输出:
VectorOfMeans <- ave(irisdf[,1], irisdf[,5], FUN=mean)
所以最后一个问题是,如何将VectorOfMeans 添加到irisdf,我尝试了以下代码,它有效:
irisdf=as.ffdf(iris)
VectorOfMeans <- as.ffdf(as.ff(ave(irisdf[,1], irisdf[,5], FUN=mean)))
irisdf <- cbind.ffdf2(df,VectorOfMeans )
with cbind.ffdf2 from SO 答案,但我想,SO 问题是关于更具体的问题然后主要的,我想有一个更容易(更快)方法来做到这一点。我希望能够在获得的数据集上运行bigglm.ff(例如irisdf),你应该看看我关于在这种情况下合并VectorOfMeans和irisdf的问题(因为物理/虚拟模式存在问题我不了解的存储)。
【问题讨论】:
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我不认为机器和数据约束是明确的。还有一些赋值方法可以接受“i”-argument 请参阅 ?'[?'[<-.ffdf',了解此类对象的赋值函数的帮助页面。
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@BondedDust 是的,甚至还有
condMean,用于条件均值,但输出的长度是类数,而不是数据集中的行数,并且类标签不被视为变量。跨度> -
在基础 R 中,这对于
ave函数来说是个问题。即使是最简单的测试,您也没有发布最小的测试用例。 -
我不清楚......不是 ff 用户......是否可以或不能使用带有 ff 向量的普通函数。因此,我建议您发布一个可重现的示例。您发布了一个 data.table 示例,...现在发布一个 ff 示例。当代码在我的机器上运行时,您的 irisdf 不是 ffdf 对象。
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@BondedDust 你说得对
ave
标签: r data.table ff ffbase