在 Cygwin 上安装 HDF5 库：“make check”卡在 testwmr.sh，没有错误消息答案

【问题标题】：Installing HDF5 library on Cygwin: "make check" stuck at testswmr.sh, no error message在 Cygwin 上安装 HDF5 库：“make check”卡在 testwmr.sh，没有错误消息
【发布时间】：2017-09-01 10:40:29
【问题描述】：

我目前正在 Cygwin 上安装 HDF5 库，更准确地说是 hdf5-1.10.0-patch1，因为我想将它与 Fortran 一起使用。按照 hdfgroup 网站的说明进行操作 (here is the link)，我做了以下事情：

./configure --enable-fortran
make > "out1_check.txt" 2> "warn1_check.txt" &
make check > "out2_check.txt" 2> "warn2_check.txt" &

最后一个命令 (make check) 的执行按原样继续执行，直到卡住。该进程没有停止并且正在发生一些事情（sh.exe 正在使用 8-12% 的 CPU，已经 39 小时的 CPU 时间）但是“out2_check.txt”看起来像

Making check in src
...
[many successful checks]
...
============================
No need to test testlinks_env.sh again.
============================
============================
Testing testswmr.sh

不幸的是，我没有make check 第一次运行的输出文件，但它没有包含有关Testing testswmr.sh 的更多信息。从来没有任何错误消息。

那么，这是什么testswmr.sh，为什么会卡住，我该如何完成安装过程？也许我可以跳过剩下的检查，直接转到make install？

重要提示：旧版本的 HDF5 已从 Cygwin 存储库安装。但是它似乎不支持 Fortran，所以我决定自己安装当前版本。

可用的（和使用的）编译器是 gcc 和 gfortran。

【问题讨论】：

您是否尝试查看testswmr.sh 以了解它的作用？（你应该）
嗯，我看了，但我并不太明白 t 详细做了什么。它由几个测试组成，例如“## Writer test - 测试扩展数据集”、“## Remove test - 测试缩小数据集”、“## Sparse writer test - 测试写入数据集中的随机位置”等。

标签： fortran cygwin gfortran hdf5

【解决方案1】：

据我所知，Windows 仅支持 Intel Fortran。 https://support.hdfgroup.org/HDF5/release/obtain518.html 这里没有 Cygwin 下载，我从未遇到过 Cygwin/Fortran/HDF5 的经验报告。

您的选择：

使用英特尔 Fortran
使用 Linux 或 Mac

对不起

【讨论】：

感谢@Pierre 的回答！当我看到 Cygwin-repo hdf5 包仅包含 C 时，我还认为 Cygwin Fortran HDF5 不受支持。但是，基于我在上面问题中提到的this instructions file，可以使用 hdf5 的 Unix 源和从 Cygwin 中手动安装它（并且明确提到可以使用 --enable-fortran 标志）。这就是我想要做的。
好的，我现在确实检查了链接的说明 :-) 这仍然是一个几乎没有使用过的组合，但 SWMR 功能（单写多读）取决于文件系统，可能不适用于 FAT 磁盘。我在内存中没有引用，但您应该检查 SWMR 兼容性。如果不支持，则测试失败没有问题，但您不应使用该功能。
谢谢@PierredeBuyl！现在我不需要 SWMR，但我已经设法按原样安装库。使用正确的 $LD_LIBRARY_PATH、$LIBRARY_PATH 和包含标志的值，代码编译并且输出非常好。我解决它的方法：卸载所有内容，重新启动，使用“make check > output_check.dat”，“make install”再次安装；）这可能是防病毒软件或过期的 Windows 更新导致之前停止安装。但是，如果您添加一个注释，说明在 Cygwin 下仍然可以使用 Unix-source 为 Fortran 安装 HDF5，我可以接受您的回答