AttributeError：“数据集”对象没有属性“值”答案

【问题标题】：AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'AttributeError：“数据集”对象没有属性“值”
【发布时间】：2021-07-28 06:49:55
【问题描述】：

使用包读取 hdf5 文件时出现此错误：

dataset.value

错误：

Traceback (most recent call last):
  File "train.py", line 163, in <module>
    train(0, False, args.gpu_list, args.model_path)
  File "train.py", line 76, in train
    dataset = Ani1Dataset(dir_path='/data/ANI-1_release')
  File "/code/ani1dataset.py", line 16, in __init__
    self.parse(dir_path)
  File "/code/ani1dataset.py", line 32, in parse
    for molecule in adl:
  File "/code/pyanitools.py", line 75, in __iter__
    for data in self.h5py_dataset_iterator(self.store):
  File "/code/pyanitools.py", line 71, in h5py_dataset_iterator
    yield from self.h5py_dataset_iterator(item, path)
  File "/code/pyanitools.py", line 60, in h5py_dataset_iterator
    dataset = np.array(item[k].value)
AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'

【问题讨论】：

在上面的代码中，如果item[k]引用了一个HDF5数据集，你可以使用dataset = item[k][:]将它读入一个NumPy数组。干净多了。此外，如果没有令人信服的理由，我不会降级到 h5py 2.9.0。它于 2014 年发布。当前的 h5py 版本为 3.2，支持较新的 HDF5 格式，并具有许多增强功能和纠错功能。

标签： hdf5 h5py

【解决方案1】：

dataset.value 属性已被弃用。要么使用：

dataset[()]

或降级 h5py 以使用旧语法：

pip3 install --upgrade pip && pip3 install h5py=='2.9.0'

【讨论】：

【解决方案2】：

是的，.value 已被弃用一段时间。正如我在上面的 cmets 中提到的，如果没有令人信服的理由，我不会降级到 h5py 2.9.0。它于 2014 年发布。当前的 h5py 版本为 3.2，支持最新的 HDF5 格式，并有许多增强和纠错。

使用 h5py 访问 HDF5 数据有两种主要方法。简而言之，您可以：

返回一个 h5py 数据集对象。数据集对象的行为“就好像”它是一个数组，但在需要之前不会将数据加载到内存中。
返回一个 NumPy 数组。这会立即将数据加载到内存中。

Complete h5py dataset documentation here:
以下各示例：

with h5py.File('filename.h5','r') as h5f:
    # return a h5py dataset object:
    my_ds_obj = h5f[ds_name]
    # return a h5py dataset object:
    my_ds_arr = h5f[ds_name][:]

另外，如果你只想读取部分数据，h5py 支持大多数 NumPy 切片语法，包括花式索引的子集。 h5py fancy indexing doc

【讨论】：