使用 R 获取 HDF5 对象内对象的列名答案

【问题标题】：Get column names of objects inside HDF5 object with R使用 R 获取 HDF5 对象内对象的列名
【发布时间】：2017-01-23 08:58:50
【问题描述】：

我创建了一个虚拟 HDF5 对象

libray(rhdf5)
handle = h5createFile("rhd5file.h5")
df_A <- data.frame(height = rnorm(20,55,3), index = c(1:20))
df_B <- data.frame(age = rnorm(10,30,5), address = sample(letters,size= 10,replace = TRUE))
h5write(df_A, "rhd5file.h5", "A")
h5write(df_B, "rhd5file.h5", "B")
h5close(handle)

现在，我只想检索对象df_A 和df_B 的列名，而不读取整个文件rhd5file.h5。有可能吗？

我尝试了h5readAttributes() 和h5ls()，但没有一个会在不读取整个对象的情况下显示列名

需要的输出：

A: height, index
B: age, address

【问题讨论】：

标签： r hdf5 rhdf5

【解决方案1】：

您可以在属性中写入 colnames，然后您可以在不读取整个文件的情况下读取它们：

library(rhdf5)
 handle = h5createFile("rhd5file.h5")
 df_A <- data.frame(height = rnorm(20,55,3), index = c(1:20))
 df_B <- data.frame(age = rnorm(10,30,5), address = sample(letters,size= 10,replace = TRUE))
 h5write(df_A, "rhd5file.h5", "A")
 h5write(df_B, "rhd5file.h5", "B")

 file=H5Fopen("rhd5file.h5")
 did <- H5Dopen(file,"A")
 h5writeAttribute(did, attr=names(df_A),name="colnames")

 H5Dclose(did)
 H5close()

 h5readAttributes("rhd5file.h5","A")

希望对您有所帮助。

【讨论】：