在 iPython 中使用 HDF5 文件时出现异常“HDFStore 需要 PyTables”答案

【问题标题】：Exception 'HDFStore requires PyTables ' when using HDF5 file in iPython在 iPython 中使用 HDF5 文件时出现异常“HDFStore 需要 PyTables”
【发布时间】：2013-03-06 08:42:17
【问题描述】：

我对 Python 非常陌生，我正在尝试使用 HDFStore 在 pandas 中创建一个表，如下所示

store = HDFStore('store.h5')

我得到了例外：

Exception                                 Traceback (most recent call last)
C:\Python27\<ipython-input-11-de3060b689e6> in <module>()
----> 1 store = HDFStore('store.h5')

C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.10.1-py2.7-win32.egg\pandas\io\pytables.pyc in __init__(self, path, mode, complevel, complib, fletcher32)
    196             import tables as _
    197         except ImportError:  # pragma: no cover
--> 198             raise Exception('HDFStore requires PyTables')
    199 
    200         self.path = path

Exception: HDFStore requires PyTables

我已经安装了 Pytables，它存在于站点包中。 pandas(0.l0.1) 和 pytables(2.4.0) 都是 32 位 Windows 版本。 32 位 Windows 的 Python 版本为 2.7.3

我正在使用 ipython notebook 运行它。

我忘了补充说我有 Windows 7 - 64 位操作系统，但 Python 及其所有相关插件都是 32 位的。

【问题讨论】：

如果你运行import tables会发生什么？
引发导入错误：ImportError Traceback (most recent call last) C:\Python27\<ipython-input-12-389ecae14f10> in <module>() ----> 1 import tables C:\Python27\lib\site-packages\tables\__init__.py in <module>() 67 68 # Necessary imports to get versions stored on the cython extension ---> 69 from tables.utilsExtension import getPyTablesVersion, getHDF5Version 70 71 ImportError: cannot import name getPyTablesVersion
我忘了补充说我有 Windows 7 - 64 位操作系统，但是 Python 和所有相关的附加组件都是 32 位的，这可能是个问题吗？
我不这么认为。你是如何安装 pytables 的？你确定一切都编译了吗？您可以尝试使用其中一个设置文件from here。
谢谢，我回过头来发现我没有正确编译它，因为我没有安装HDF5库。

标签： python pandas hdf5

【解决方案1】：

我怀疑您的问题是您尚未将 Python 脚本添加到您的系统 PATH。假设查看this tutorial 了解如何操作。

您正在寻找添加C:\Python27, C:\Python27\Lib. and C:\Python27\Scripts。确保用; 分隔每一个。还要确保将其添加到您的系统 PATH 变量中，而不仅仅是您的用户 PATH 变量中。

检查完import pytables。它不应再抛出错误，因为 python 将“知道” pytables 已安装并能够找到它。

【讨论】：

【解决方案2】：

我有同样的问题。我正在使用 win7 + anaconda python2.7 + IPython。

但我通过以下步骤修复了它：

来自http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pytables
下载文件表-3.2.1-cp27-none-win_amd64.whl

然后用 cmd 安装

pip install tables‑3.2.1‑cp27‑none‑win_amd64.whl

安装后问题解决。

参考：http://www.pytables.org/usersguide/installation.html#binary-installation-windows

【讨论】：

【解决方案3】：

我在使用 HDFStore 时也遇到了同样的错误。我尝试了上面指定的所有步骤并花了很多时间寻找解决方案，但没有一个成功。

然后我下载并安装了MiniConda。然后我使用以下命令安装 pytables。

conda install -c conda-forge pytables

请参考以下截图。

【讨论】：