Pandas HDFStore 奇怪的行为

Question

我对此感到非常困惑，我有两个脚本从同一个笔记本服务器运行。我在同一个文件夹中有一个 HDFStore，但是对于一个脚本，它看起来是空的，而对于另一个则不是。以下是在两个笔记本中运行的相同代码：

import os 
os.getcwd()

返回 NB 1：'E:\DoingDataScience\Identify\Scripts'

返回 NB 2：'E:\DoingDataScience\Identify\Scripts'

store = pd.HDFStore('data_test.h5')
store.items

返回NB 1：

<bound method HDFStore.items of <class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: data_test.h5
/test_database            frame        (shape->[3,5])>

返回 NB 2：

<bound method HDFStore.items of <class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: data_test.h5
Empty>

所有情况看起来都一样。它是否跟踪 Pandas DF 的来源？我认为这可能是由于 NB 1 已经打开了该文件，因为 NB 1 创建了它。但是杀死 NB 1 并重新启动 NB 2 也没有任何作用。

编辑：添加 os.stats：

NB 1 和 NB 2 都有：

nt.stat_result(st_mode=33206, st_ino=0L, st_dev=0L, st_nlink=0, 
st_uid=0, st_gid=0, st_size=1311400L, st_atime=1465072325L, 
st_mtime=1465149771L, st_ctime=1465072325L)

更新：现在重新启动后我收到一个新错误：

HDF5ExtError：HDF5 错误回溯

文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5F.c”，第 604 行，在 H5Fopen 无法打开文件 文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fint.c”，第 1085 行，在 H5F_open 无法读取超级块 文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fsuper.c”，第 294 行，在 H5F_super_read 无法加载超级块 文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5AC.c”，第 1320 行，在 H5AC_protect 中 H5C_protect() 失败。 文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5C.c”，第 3574 行，在 H5C_protect 中 无法加载条目 文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5C.c”，第 7954 行，在 H5C_load_entry 无法加载条目 文件“C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fsuper_cache.c”，第 476 行，在 H5F_sblock_load 截断文件：eof = 800，sblock->base_addr = 0，stored_eoa = 1181448

HDF5 错误回溯结束

无法打开/创建文件“data_test.h5”

Answer 1

很可能您已经编写了数据

/test_database            frame        (shape->[3,5])>

在 NB1 的会话中并且没有关闭 store（这会将您的更改保存并刷新到文件/磁盘）

因此，当您在 NB2 中打开 h5 文件时，它尚未刷新，因此为空。