使用 Python 包 hdf5storage 将新变量添加到 .mat 文件答案

【问题标题】：Adding a new variable to a .mat file using the Python package hdf5storage使用 Python 包 hdf5storage 将新变量添加到 .mat 文件
【发布时间】：2015-03-31 16:13:52
【问题描述】：

是否可以使用 Python 包 hdf5storage 向 .mat 文件 (v7.3) 添加新变量？

例子：

我用 Matlab 写的：

test = {'Hello', 'world!'; 'Good', 'morning'; 'See', 'you!'};
save('data.mat', 'test', '-v7.3') % v7.3 so that it is readable by h5py

在 Python 中，我想向data.mat 添加一个新变量。我该怎么做才能达到以下目的：

我试过了：

import hdf5storage # get code on https://pypi.python.org/pypi/hdf5storage/0.1.3
import numpy as np

matcontent = {}
matcontent[u'some_numbers'] = np.array([10, 50, 20]) # each key must be a unicode string
hdf5storage.write(matcontent, '.', 'data.mat', matlab_compatible=True)

但它会覆盖 data.mat 而不是添加新变量。

【问题讨论】：

一定要用hdf5storage吗？ Scipy 也提供此功能。
scipy 仅支持版本 5 格式。

标签： python matlab hdf5 hdf5storage

【解决方案1】：

到目前为止，我知道这是不可能的。 TheBlackCat 提供的答案在您重写文件时并不真正适用。我倾向于拥有非常大的 matlab 文件，我通常不想完全阅读这些文件，而是有选择地读取或写入。这是 .mat 文件中使用的底层 HDF5 格式的一大优势（连同引用）。 python 包 hdf5storage 仍然是 0.xx 版本，所以我想这将在未来的版本中出现。

【讨论】：

【解决方案2】：

您正在创建新数据，然后将新数据写入文件。这会覆盖文件。您需要加载原始的.mat 文件，附加到它，然后再次保存。

import hdf5storage
import numpy as np

matcontent = hdf5storage.loadmat('data.mat')
matcontent[u'some_numbers'] = np.array([10, 50, 20])
hdf5storage.savemat('data.mat', matcontent)

然后在 Matlab 中

>> whos -file data.mat
      Name              Size            Bytes  Class    Attributes

      some_numbers      1x3                24  int64              
      test              3x2               730  cell

【讨论】：