从 MATLAB 到 Python 中的 Pandas DataFrame 的 HDF5 数据集答案

【问题标题】：HDF5 dataset from MATLAB to Pandas DataFrame in Python从 MATLAB 到 Python 中的 Pandas DataFrame 的 HDF5 数据集
【发布时间】：2017-10-27 21:04:03
【问题描述】：

我有带有 HDF5 数据的 .mat 文件，我想将其加载到 Python (Pandas DataFrame) 中。我可以加载文件：

f2 = h5py.File("file.mat")
f2['data']

这是一个 HDF5 数据集：

<HDF5 dataset "data": shape (9999999, 32), type "<f8">

如果我用 Pandas 阅读它：

g = pd.read_hdf("file.mat",'data')

我收到以下错误：

cannot create a storer if the object is not existing nor a value are passed

如何将其转换为 Pandas DataFrame？

【问题讨论】：

标签： python matlab pandas hdf5 data-science-experience

【解决方案1】：

AFAIK 你无法使用 Pandas 方法读取 HDF5 文件，这些文件不是使用 Pandas 编写的。

您可以使用以下方法之一阅读它们：

read matlab v7.3 file into python list of numpy arrays via h5py

Reading ALL variables in a .mat file with python h5py

http://poquitopicante.blogspot.de/2014/05/loading-matlab-mat-file-into-pandas.html

Read .mat files in Python

【讨论】：

我想知道它无法完成是我必须接受的答案。我可能会走 numpy 数组路线。感谢您的信息。

【解决方案2】：

在第一个示例中，您的文件是 "file.mat"，在第二个示例中是 "data.mat"

【讨论】：