如何从 MATLAB 更改 HDF5 文件中的数据类型？答案

【问题标题】：How do I change the data type in an HDF5 file from MATLAB?如何从 MATLAB 更改 HDF5 文件中的数据类型？
【发布时间】：2013-08-02 10:03:57
【问题描述】：

我有一个 HDF5 数据文件，其中包含一个 int32 数据值数组。我希望将存储在该数组中的数据更改为具有不同格式（双精度）的不同值。

例如，我可以使用以下方式查询数据类型：

 finf=h5info('file.hdf5');
 finf.Datasets(1).Datatype

 ans = 

      Name: ''
      Class: 'H5T_INTEGER'
      Type: 'H5T_STD_I32LE'
      Size: 4
      Attributes: []

如果我尝试在同一节点位置重新创建数据，则会出现以下错误，即数据集已存在：

t=double(h5read([filepath filename],'/t'));

% more t calculations here....

h5create('file.hdf5','/t',size(t),'DataType','double');

Error using h5create>create_dataset (line 159)
The dataset '/t' already exists.

Error in h5create (line 69)
create_dataset(options);

我在 Matlab 文档中查找了用于删除 hdf5 文件中的数据集的函数，但找不到任何参考。有人有什么想法吗？

【问题讨论】：

标签： matlab hdf5

【解决方案1】：

根据This post 这是一个类似的问题，没有用于删除 HDF5 文件中的数据集的机制。也表示可以Modify in place。

【讨论】：

可以修改数据，但不是数据类型！

【解决方案2】：

无法删除数据集或更改其数据类型。来自HDF5 manual的第5.3.2节：

The datatype is set when the dataset is created and can never be changed.

这是由于 HDF5 文件中的空间分配方式造成的。虽然无法删除数据集（出于同样的原因），但可以“取消链接”并使其无法访问，但这不会回收已用空间。

如果您确实需要更改数据类型，您有两个选择：第一个是取消链接旧数据集并在其位置创建一个新数据集。新数据集可以与旧数据集同名。但是，如果担心空间问题，您可能更愿意创建一个全新的 HDF5 文件，然后将旧数据复制到新文件中。

【讨论】：

谢谢，我将数据复制到一个新文件中。