使用犰狳和 hdf5 库的简单代码的 C++ 构建错误

Question

我对 C++ 和犰狳还是很陌生，我遇到了下面描述的构建错误。我正在尝试测试以下简单代码以将犰狳矩阵保存为 hdf5 文件：

#include <iostream>
#include <armadillo>

using namespace std;
using namespace arma;

int main()
{
    mat A = randu<mat>(240,320);
    A.save("A.hdf5",hdf5_binary);

    return 0;
}

编译时出现以下错误：

/usr/include/armadillo_bits/hdf5_misc.hpp:131: undefined reference in « arma_H5T_NATIVE_DOUBLE »
/usr/include/armadillo_bits/hdf5_misc.hpp:131: undefined reference in « arma_H5Tcopy »
obj/Debug/main.o: in function « bool arma::diskio::save_hdf5_binary<double>   (arma::Mat<double> const&, std::string const&) »:
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1299: undefined reference in « arma_H5Eset_auto »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1308: undefined reference in « arma::H5check_version(unsigned int, unsigned int, unsigned int) »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1308: undefined reference in « arma_H5Fcreate »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1315: undefined reference in « arma_H5Screate_simple »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1324: undefined reference in « arma_H5Dcreate »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1330: undefined reference in « arma_H5Dwrite »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1333: undefined reference in « arma_H5Dclose »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1334: undefined reference in « arma_H5Tclose »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1335: undefined reference in « arma_H5Sclose »
/usr/include/armadillo_bits/diskio_meat.hpp:1336: undefined reference in « arma_H5Fclose »

编译说明如下：

g++ -Wall -fexceptions -O2 -g -larmadillo -lhdf5 -c main.cpp -o main

我正在 Linux Fedora 20 系统上使用 CodeBlocks。我有打包的 HDF5-devel，可以在 /usr/include/ 中找到 hdf5.h 我还使用config.hpp 中的#define ARMA_USE_HDF5 在犰狳中激活了hdf5。我使用最新版本的犰狳 (4.450) 和 gcc 4.8.3。

我错过了链接吗？对我来说，添加 -larmadillo 和 -lhdf5 （如犰狳的用户指南中所述）就足够了。有什么线索吗？ 谢谢

Answer 1

由于基于 Linux 的系统上不同版本的 HDF5 库存在各种问题，Armadillo 的作者已禁用 HDF5 库的自动检测。如果您想将 HDF5 与犰狳一起使用，有两种选择：

1。 解压 armadillo .tar.gz 包，然后编辑 CMakeLists.txt 文件。取消注释第 231 到 238 行，以 find_package(HDF5) 开头（即删除 # 字符）。修改 CMakeLists.txt 后，按照 README.txt 文件中的说明运行基于 cmake 的安装。

或

2。 正常安装犰狳（无需修改 CMakeLists.txt），然后使用（全部在一行上）编译您的程序：

g++ main.cpp -o main -O2 -DARMA_DONT_USE_WRAPPER -DARMA_USE_BLAS -DARMA_USE_LAPACK -DARMA_USE_HDF5 -lblas -llapack -lhdf5

奖励积分： 如果您安装了高速 OpenBLAS 库并希望 Armadillo 使用它而不是标准 BLAS，请将 -lblas 更改为 -lopenblas