HDF5 C++ 的链接器问题答案

【问题标题】：Linker problems with HDF5 C++HDF5 C++ 的链接器问题
【发布时间】：2016-10-24 20:57:00
【问题描述】：

我已经开始学习 HDF5 并且无法通过 HDF5 C++ 的以下问题。

（背景信息：我已经通过 Homebrew 在 OSX El Capitan 上安装了 hdf5。我已经使用通用 C API 和 Python 模块 h5py 成功完成了一些程序，但 C++ API 无法正常工作。）

这是我的命令的一个示例：

h5c++ simple.cpp

我尝试编译但收到以下错误：

Undefined symbols for architecture x86_64:
  "H5::H5File::H5File(...)" ...
  "H5::CommonFG::createDataSet(...)" ...
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

其他信息：

我包括 H5Cpp.h。我的印象是它是我需要包含的唯一文件。

起初，我认为 C++ 可能不会默认启用，尽管我在 the Homebrew formula 中读到了这些内容。作为仔细检查，我卸载并重新安装了--with-cxx（显然，这不起作用）。

这些错误真正告诉我什么？为什么我的 C++ HDF5 程序不起作用？有什么我应该知道的技巧吗？

【问题讨论】：

这些是链接器错误——您提供了哪些链接器（或编译器）选项？
@Soren 更新了问题。我已经尝试了各种方法，但只是最基本的 h5c++ 命令给出了相同的错误。

标签： c++ macos homebrew hdf5

【解决方案1】：

我在与一些朋友合作并使用 h5c++ 的详细输出时发现了这个问题：

    h5c++ -v simple.cpp

我已经安装了 HDF5 附带的 anaconda 平台。我不确定该错误是否是由于 anaconda HDF5 和 Homebrew HDF5 之间的冲突造成的，但使用 Homebrew HDF5 可执行文件可以解决问题。

我实际上做的是卸载 anaconda。

（或者，我可以将我的 PATH bash 变量修复为不包含 anaconda 工具。在~/.bash_profile 中，anaconda 平台安装添加了一行更新 PATH 以包含其工具。注释掉该行并重新启动 bash，或修改PATH 手动停止了 HDF5 版本之间的冲突。）

【讨论】：