HDF5变长结构，变长（C API）答案

【问题标题】：HDF5 variable length structure, of variable length (C API)HDF5变长结构，变长（C API）
【发布时间】：2015-05-21 19:26:14
【问题描述】：

我想将 STL 容器中包含的数据写入 HDF5 文件。根据我收集的信息，我需要声明一个连续的内存块并使用"hdf5.h" C API 将数据从内存缓冲区传输到磁盘。

对于常规数据空间，过程很简单；只需使用new 在堆栈上创建临时数组。 HDF5“理解”这样的内存布局。当处理不规则数据空间时，情况就不同了，因为必须使用专用类型 hvl_t。

以下 sn-p 有效，但不是 ISO C++(11)：

// Test data
std::vector< std::vector<int> > jagged_array(3);
jagged_array[0] = {0};
jagged_array[1] = {0, 1, 2, 3};
jagged_array[2] = {0, 1, 2};

hvl_t X[jagged_array.size()];
for (unsigned int i = 0; i < jagged_array.size(); ++i) {
    X[i].len = jagged_array[i].size();
    int * ptr = (int *) malloc (X[i].len * sizeof(int));
    for (unsigned int j = 0; j < X[i].len; ++j) {
        ptr[j] = jagged_array[i][j];
    }
    X[i].p = (void *) ptr;
}

我的 C非常生锈了；除了非法行 hvl_t X[jagged_array.size()]; 之外，这个 sn-p 几乎完全是从 HDF5 示例页面中删除的。

我应该如何声明一个hvl_t，其大小在运行时确定？它肯定涉及malloc，但我真的很难过。

【问题讨论】：

你试过hvl_t * X = (hvl_t *)malloc(jagged_array.size() * sizeof(hvl_t));吗？
感谢@Lashane 的快速回答。我刚试过，它会产生错误error: invalid conversion from ‘void*’ to ‘hvl_t*’
感谢您发布错误，我已将演员表添加到示例中
是的，你可以阅读任何关于 c 的书，不要使用 c++ 书籍，通常这部分称为动态数组
@JGab：如果您的编译器抱怨从 void * 到 hvl_t * 的转换，它不是 C 编译器。 C 编译器会自动执行此操作； C++ 编译器没有。

标签： c memory memory-management malloc hdf5

【解决方案1】：

我知道这已经有一段时间了，但我今天遇到了这个问题。这是一个适当的c++解决方案，不分配额外的内存，而只是将指向向量的指针存储在vlen_t中：

// Test data
std::vector< std::vector<int> > jagged_array(3);
jagged_array[0] = {0};
jagged_array[1] = {0, 1, 2, 3};
jagged_array[2] = {0, 1, 2};

hvl_t X[jagged_array.size()];
for (unsigned int i = 0; i < jagged_array.size(); ++i) {
    X[i].len = jagged_array[i].size();
    X[i].p = (void*) &jagged_array[i].front();
}

【讨论】：

【解决方案2】：

@Lashane 在 cmets 中回答：

应该简单地使用

hvl_t * X = (hvl_t *)malloc(jagged_array.size() * sizeof(hvl_t))

【讨论】：