如何在现有文件中获取 HDF5 块尺寸？答案

【问题标题】：How to get HDF5 chunk dimensions in existing file?如何在现有文件中获取 HDF5 块尺寸？
【发布时间】：2021-01-07 23:58:33
【问题描述】：

我正在编写一些代码来使用 C HDF5 API 删除现有 HDF5 文件的某些部分（一些维度、一些数据集等）。我希望新的 HDF5 文件与我现有的 HDF5 文件具有相同的块大小，但我似乎无法找到可以检索当前块尺寸的任何地方。有 H5P_GET_CHUNK 函数，但它只在数据集创建时检索块维度。还有 H5D_GET_CHUNK_STORAGE_SIZE 函数，它只检索总大小（而不是尺寸）。

有没有办法从我丢失的现有数据集中检索块尺寸（不仅仅是总大小）？

【问题讨论】：

我同意下面的 cmets。块属性在 Python 中可用（位于 C API 之上）。因此，应该有一种方法可以在 C 中执行此操作。您是否在 The HDF Group 论坛上提问过？那里的人应该能够解释程序。

标签： c hdf5

【解决方案1】：

您可能想看看HDFql，因为它是一种（非常）简单的操作 HDF5 文件的方法，特别是用于获取某个数据集的存储维度（即块大小）。例如，如果要获取名为 dset 的数据集的存储维度，请执行以下操作：

SHOW STORAGE DIMENSION dset

有关此操作的更多信息，请参阅reference manual 的第 6.7.15 节。

【讨论】：

这很有趣，但我真的很想避免将 另一个 库集成到这个项目中，坦率地说，许可证把我吓坏了。此外，我无法自己编译库是不行的，因为我确实希望能够将代码部署到使用自己的 MPI 的 HPC 上。不过建议很好。
显然有一种方法可以在 HDF5 中执行此操作，因为 h5dump 和此工具都可以执行此操作，但我无法解开 h5dump 的意大利面，并且该项目不是开源的。
@Laxsnor：根据参考手册，HDFql 没有发布自己的 MPI 库，而是（动态）加载安装在机器/HPC 环境中的库。