如何为 pycaffe 创建 3D 数据的 HDF5 数据库？

Question

我的问题听起来很简单，但是，我很难从以nii 格式保存的图像和手动分割（标签文件）的 3d 医学图像创建 Hdf5 数据集。我的问题是：

1. pycaffe中的blob形状是N*C*W*H，matcaffe中的顺序不同吗？例如，在 pycaffe 中，对于宽度和高度为 320×320 和 60 个切片的灰度体积，数据 blob 形状将为 1*1*60*320*320。我尝试使用Matlabcode 为3D 数据创建HDF5 数据集，hdf5info 文件中的blob 顺序对于data 和label 都是320*320*60*1*1。我应该如何将 Matlab 代码中的顺序更改为在 Pycaffe 中可读？
2. 是否有任何 python 代码用于为 3D 数据创建 hdf5 数据库？
3. 如果我在 Matlab 中创建 hdf5 数据并使用 pycaffe 列表，会引发问题吗？

谢谢

Answer 1

Matlab 将 ND 数组中的元素从第一个维度排列到最后一个维度（如 fortran），而 caffe 和 hdf5 将数组从最后一个维度存储到第一个维度（“col-major”）。
This answer 解释如何简单地修改 Matlab 的代码以将“col-major”数组写入 HDF5 文件。
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