如何获取 HDF5 属性的本机类型？

Question

我正在使用 Visual Studio (C#) 和 HDF5 P/Invoke。

我制作了一个 HDF5 文件，其中包含具有不同数据类型属性的组和数据集（在这种情况下，假设它是一个整数，保存为 H5T.NATIVE_INT32，但我对其他数据类型也有同样的问题）。现在我正在编写一个代码来从 HDF5 文件中读取数据。要读取属性值，我首先需要确定属性值的数据类型。我尝试了以下方法：

attributeId = H5A.open(groupId, attributeName, H5P.DEFAULT);
hid_t attributeSpace = H5A.get_space(attributeId);
H5S.class_t extentType = H5S.get_simple_extent_type(attributeSpace);
hid_t typeId = H5A.get_type(attributeId);
attributeClass = H5T.get_class(typeId);
type = H5T.get_native_type(typeId, H5T.direction_t.DEFAULT);
H5T.close(typeId);

但是，结果变量 type 与 H5T.NATIVE_INTEGER 类型或我能想到的任何其他 H5T 类型不匹配。事实上，甚至

H5T.get_native_type(H5T.NATIVE_INT,H5T.direction_t.DEFAULT) == H5T.NATIVE_INT

返回false，所以看起来H5T.get_native_type() 没有返回类型，但可能是它的副本或指针，这与类型本身不同。这是预期的行为还是错误？关于如何正确判断属性值类型的任何想法？

Answer 1

解决问题的另一种方法（即找出 HDF5 属性的数据类型）是使用 C# 的工具 HDFql，如下所示：

using AS.HDFql;

public class Example
{
    public static void Main(string []args)
    {

        int dataType;

        // create an HDF file named "example.h5" and use (i.e. open) it
        HDFql.Execute("CREATE AND USE FILE example.h5");

        // create an attribute named "attrib" of type float
        HDFql.Execute("CREATE ATTRIBUTE attrib AS FLOAT");

        // get data type of attribute "attrib" and populate HDFql default cursor with it
        HDFql.Execute("SHOW DATA TYPE attrib");

        // move HDFql default cursor to first position
        HDFql.CursorFirst();

        // retrieve data type from HDFql default cursor
        dataType = HDFql.CursorGetInt();

        // print message according to data type
        if (dataType == HDFql.TinyInt || dataType == HDFql.VarTinyInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is a char");
        else if (dataType == HDFql.UnsignedTinyInt || dataType == HDFql.UnsignedVarTinyInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is an unsigned char");
        else if (dataType == HDFql.SmallInt || dataType == HDFql.VarSmallInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is a short");
        else if (dataType == HDFql.UnsignedSmallInt || dataType == HDFql.UnsignedVarSmallInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is an unsigned short");
        else if (dataType == HDFql.Int || dataType == HDFql.VarInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is an int");
        else if (dataType == HDFql.UnsignedInt || dataType == HDFql.UnsignedVarInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is an unsigned int");
        else if (dataType == HDFql.BigInt || dataType == HDFql.VarBigInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is a long long");
        else if (dataType == HDFql.UnsignedBigInt || dataType == HDFql.UnsignedVarBigInt)
            System.Console.WriteLine("Data type is an unsigned long long");
        else if (dataType == HDFql.Float || dataType == HDFql.VarFloat)
            System.Console.WriteLine("Data type is a float");
        else if (dataType == HDFql.Double || dataType == HDFql.VarDouble)
            System.Console.WriteLine("Data type is a double");
        else if (dataType == HDFql.Char || dataType == HDFql.VarChar)
            System.Console.WriteLine("Data type is a char");
        else if (dataType == HDFql.Opaque)
            System.Console.WriteLine("Data type is an opaque");
        else if (dataType == HDFql.Enumeration)
            System.Console.WriteLine("Data type is an enumeration");
        else if (dataType == HDFql.Compound)
            System.Console.WriteLine("Data type is a compound");
        else
            System.Console.WriteLine("Unknown data type");

    }

}

如果您需要获取属性attrib 的字节序或大小，请执行HDFql.Execute("SHOW ENDIANNESS attrib"); 或HDFql.Execute("SHOW SIZE attrib");。

Answer 2

HDF5 封装数据，您应该使用 HDF5 例程来处理它们。您获得的值称为“类型标识符”，它们是 HDF5 不透明数据类型。

您应该使用H5Tequal 来评估两个类型标识符的类型是否相等

H5Tequal(type, H5T.NATIVE_INT)

PS：我是从 C API 到 HDF5 的角度来写这篇文章的，希望它也适用于你的情况。