使用文件中的文本作为变量批量重命名文件

【问题标题】：Batch renaming files with text from file as a variable使用文件中的文本作为变量批量重命名文件
【发布时间】：2018-09-01 06:48:24
【问题描述】：

我正在尝试将标题为 {out1.hmm, out2.hmm, ... , outn.hmm} 的文件转换为基于文件 {PF12574.hmm, PF09847.hmm, PF0024.hmm} 该脚本适用于单个文件，但是变量不会被覆盖，并且只有一个文件保留在运行以下命令后：

for f in *.hmm; do output="$(sed -n '3p' < $f | awk -F ' ' '{print $2}' | cut -f1 -d '.' | cat)" | mv $f "${output}".hmm; done;

第一行调用所有的 outn.hmms 作为输入。第二行设置一个变量以返回所需的唯一标识符。 SED、AWK 和 CUT 用于获取唯一标识符。该变量应该通过唯一标识符重命名当前文件，但是该变量保持锁定并覆盖先前的文件。

out1.hmm out2.hmm out3.hmm 变成 PF12574.hmm

如何覆盖变量以获得以下文件结构：

out1.hmm out2.hmm out3.hmm 变成 PF12574.hmm PF09847.hmm PF0024.hmm

【问题讨论】：

【解决方案1】：

您正在将赋值语句的空输出（到名为“output”的变量）传送到mv 命令。该变量尚未设置，所以我认为您将 - 一个接一个地 - 将所有匹配 *.hmm 的文件重命名为名为“.hmm”的文件。

试试ls -a 看看这是否真的发生了。

sed、awk、cut 和（不需要的）cat 有点多。 awk 可以满足您的所有需求。然后将mv 作为单独的命令执行：

for f in *.hmm
do
  output=$(awk 'NR == 3 {print $2}' "$f")
  mv "$f" "${output%.*}.hmm"
done

请注意，上面没有做任何检查来验证 output 是否被分配了一个合理的值：一个非空的，即一个正确的“标识符”，等等。

【讨论】：