使用重命名替换文件名答案

【问题标题】：substitute file names using rename使用重命名替换文件名
【发布时间】：2018-08-30 15:56:46
【问题描述】：

我想通过替换以“_”开头的所有字符后跟八个大写字母并仅保留扩展名来重命名文件名。

4585_10_148_H2A119Ub_GTCTGTCA_S51_mcdf_mdup_ngsFlt.fm
4585_10_148_H3K27me3_TCTTCACA_S51_mcdf_mdup_ngsFlt.fm
4585_27_128_Bap1_Bethyl_ACAGATTC_S61_mcdf_mdup_ngsFlt.fw
4585_32_148_1_INPUT_previous_AGAGTCAA_S72_mcdf_mdup_ngsFlt.bw

预期输出

4585_10_148_H2A119Ub.fm
4585_10_148_H3K27me3.fm
4585_27_128_Bap1_Bethyl.fm
4585_32_148_1_INPUT_previous.fm

【问题讨论】：

标签： shell sed rename

【解决方案1】：

您也可以像这样使用rename（又名prename 或Perl rename）：

rename --dry-run 's|_[[:upper:]]{8}.*\.|.|' *

样本输出

'4585_10_148_H2A119Ub_GTCTGTCA_S51_mcdf_mdup_ngsFlt.fm' would be renamed to '4585_10_148_H2A119Ub.fm'
'4585_32_148_1_INPUT_previous_AGAGTCAA_S72_mcdf_mdup_ngsFlt.bw' would be renamed to '4585_32_148_1_INPUT_previous.bw'

如果输出看起来不错，删除--dry-run 并再次真正运行。

这有几个额外的好处：

如果两个文件重命名为相同的东西，它将发出警告并避免任何冲突，
它可以跨目录重命名，在途中创建任何必要的中间目录，
您可以先进行试运行以对其进行测试，
您可以使用任意复杂的 Perl 代码来指定新名称。

在 Mac 上，使用 homebrew 安装它：

brew install rename

【讨论】：

【解决方案2】：

试试这个：

for f in *; do
    target=$(echo "${f}" | sed -E 's/_[[:upper:]]{8}.*\././')
    mv "${f}" "${target}"
done

关键是sed 的-E 参数，因为它启用扩展的正则表达式。

【讨论】：

刚刚注意到我的终端出现复制/粘贴错误（忘记了 echo 的 sed 命令）。如果您尝试了这个并且没有任何反应，那就是原因。
文件被重命名为 4585_10_148_H2A119Ub_GTCTGTCA.fm 而不是 4585_10_148_H2A119Ub.fm
这对我有用：for f in $(ls); do target=$(echo "${f}" | sed -r 's/(_[[:upper:]]{8})[^.]*//') # 理智后移除回声检查输出 echo mv "${f}" "${target}" done
请不要建议解析 ls，这里只需将 $(ls) 替换为 * 即可 - 详情请参阅 mywiki.wooledge.org/ParsingLs。此外，-E 是启用 ERE 的更好选择。 . 只有一些旧版本使用sed -r 而不是sed -E
@Sundeep - 感谢您的反馈（已纳入答案）。有趣的是，我的系统上的man sed 中没有-E，但它可以工作（也尝试使用busybox sed）。

【解决方案3】：

你可以试试这个。

for i in *.fm; do mv $i $(echo $i | sed 's/_GTCTGTCA_S51_mcdf_mdup_ngsFlt//g'); done;
for i in *.fm; do mv $i $(echo $i | sed 's/_TCTTCACA_S51_mcdf_mdup_ngsFlt//g'); done;

【讨论】：

我想知道我是否可以使用任何正则表达式之王。我有 n 个具有相同模式的文件。
这个 for 循环适用于任意数量的$i's(files)