R（Ubuntu） - 无法安装软件包“readr”和“eurostat”答案

【问题标题】：R (Ubuntu) - Can't install packages "readr" and "eurostat"R（Ubuntu） - 无法安装软件包“readr”和“eurostat”
【发布时间】：2017-04-18 03:35:19
【问题描述】：

我在 R 中安装“eurostats”包时遇到问题。分解问题后，我推断问题出在“readr”包上。尝试安装它，出现这种情况：

* installing *source* package ‘readr’ ...
** libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/home/shiny/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -I"/home/shiny/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/BH/include"   -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c Collector.cpp -o Collector.o

之后，终端就像处于活动状态一样冻结，但没有任何反应。在此之前，我处理了语言环境设置（如果有帮助就提一下）。我能够安装其他软件包。

我的 R 和 Linux 详情如下：

sessionInfo()
R version 3.3.2 (2016-10-31)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.1 LTS

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] httr_1.2.1      R6_2.2.0        tools_3.3.2     withr_1.0.2    
[5] curl_2.2        memoise_1.0.0   git2r_0.16.0    digest_0.6.10  
[9] devtools_1.12.0

有人可以帮帮我吗？

【问题讨论】：

冻结后您等了多长时间？终端是否工作（cpu/内存使用）？你的包是最新的吗（old.packages(checkBuilt=TRUE)，尤其是 Rcpp 和 BH）？
我等了大约一个小时。终端过去和现在都在工作。软件包是最新的。
我刚刚发现github.com/tidyverse/readr/issues/544 报告了一个类似（如果不相同）的问题。是这种情况还是别的什么？

标签： r packages

【解决方案1】：

那台机器上的 RAM 不足。所以你有两个选择：

继续你正在做的事情并尝试从源代码编译，这将需要更多内存并且可能会失败
安装预构建的二进制文件 (!!)，这样您就不必首先编译

最简单的方法是这样的（当我在 Ubuntu 16.04 的 Docker 实例中执行此操作时，我只显示命令，而不是输出，并且我在帐户为 root 的 Docker 中执行此操作；否则在前面加sudo）

apt-get update     # refresh
apt-get install software-properties-common
add-apt-repository -y "ppa:marutter/rrutter"
add-apt-repository -y "ppa:marutter/c2d4u"
apt-get update     # now with new repos
apt-get install r-cran-readr

和瞧你有 readr 包。现在继续进行未打包为二进制文件的 eurostat，但由于其 C++ 代码，可能不需要读取器所需的更多资源。

【讨论】：

是的，这对我很有效！感谢您的解决方案@DirkEddelbuettel
CentOS 上安装 readr 遇到同样的 RAM 不足问题，你有解决方案吗？

【解决方案2】：

我的树莓派遇到了同样的问题。解决方法是增加交换的大小（在我的情况下为 1Gb）。步骤如下：

sudo swapon -s #get size and filename
sudo swapoff -a #stop the actual swaps
sudo fallocate -l 1g swap2 #allocate 1Gb for the swapfile
sudo mkswap swap2
sudo swapon swap2

启动 R 并安装您的软件包。

如果您需要恢复之前的配置：

sudo swapoff -a
sudo rm swap2
sudo swapon your-previous-swap

【讨论】：