化学表示 - SNL 到 SMILES

【问题标题】：Chemical representation - SNL to SMILES化学表示 - SNL 到 SMILES
【发布时间】：2018-10-30 07:19:13
【问题描述】：

我想知道是否可以使用 Python 将 SYBYL Line Notation (SNL) 转换为微笑？

N-甲基吡咯烷酮示例：

SNL = 'N[1](CH2CH2CH2C@1=O)CH3'
SMI = 'CN1CCCC1=O'

我还没有找到任何使用 RDKit 的解决方案 :(

【问题讨论】：

  • 如果你能提供一些例子会很有帮助。没有多少人会知道你所说的 SNL/Smiles 是什么意思。或者也许只是我：P
  • 哦，很抱歉 :)
  • 这有帮助吗？抱歉，我对域本身了解不多：cirpy.readthedocs.io/en/latest
  • 我每天都使用这个工具……真丢脸！好像没问题；）

标签： python rdkit cheminformatics


【解决方案1】：

在 RDKit 中，它在 AllChem 中。

from rdkit.Chem import AllChem as Chem
Chem.MolToSmiles(Chem.MolFromSLN('N[1](CH2CH2CH2C@1=O)CH3'))
'CN1CCCC1=O'

【讨论】：

  • 美丽：D。非常感谢
猜你喜欢
  • 2019-11-25
  • 2021-01-27
  • 2019-03-23
  • 1970-01-01
  • 1970-01-01
  • 1970-01-01
  • 1970-01-01
  • 2015-07-21
  • 1970-01-01
相关资源
最近更新 更多
热门标签
Java Python linux javascript Mysql C# Docker 算法 前端 SpringBoot Redis Vue spring 设计模式 .net core .net kubernetes c++ 数据库 数据结构 大数据 js 机器学习 微服务 Android Go 程序员 面试 JVM ASP.net core 云原生 人工智能 后端 PHP git CSS golang k8s Nginx Django mybatis 深度学习 多线程 React 架构 devops 爬虫 云计算 Spring Boot LeetCode