R如何安装包'graph'？

Question

包graph 不再在 CRAN 上可用。我发现它已移至 Bioconductor，请参阅

Bioconductor - graph

但实际上，如果我尝试运行他们建议运行的命令

install.packages("BiocInstaller")
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("graph")

我收到错误消息，即使 BiocInstaller 也不适用于最新的 R 版本 3.4.2

如何安装这个包？

Answer 1

看看这是否有效：

首先，从http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html下载zip文件

二、本地安装包：

install.packages("yourpath/graph_1.56.0.zip",repos=NULL)

然后，library(graph) 将加载包。您会收到一条警告消息，该包是在不同版本的 R 下创建的，但它可能会以这种方式工作。

Answer 2

请参阅http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html 的说明：

安装

要安装这个包，启动R（版本“3.5”）并输入：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("graph", version = "3.8")

Answer 3

不要使用这个命令：install.packages("BiocInstaller")

此页面将 Biconductor 版本转换为 R 版本https://www.bioconductor.org/about/release-announcements/

> Release   R
> 3.7, 3.8  3.5
> 3.5, 3.6  3.4
> 3.3, 3.4  3.3

对于 R 3.4.2，您需要 Bioconductor 3.6 https://www.bioconductor.org/packages/3.6/bioc/html/graph.html

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("graph")