在 R 中创建包时链接多个文件

Question

我正在尝试在 R 中创建一个包，其中我创建了许多新的自定义类。每个类都在不同的文件中。类从父类继承并继承到其他类。

在运行我的代码时，我会这样称呼它们

source("package/father.R")
source("package/son.R")
source("package/grandson.R")     

Son类中定义的孙类需要的一些方法的定义。我使用 package.skeleton() 来调用它们中的每一个并创建一个包，它似乎工作正常。但是在运行 R CMD Check（以及尝试安装到 R 中）时，它会抛出一个错误，因为该函数会尝试按字母顺序调用文件，因此文件 grandson.R 在 son.R 之前被调用，它会显示错误消息方法尚未定义。如果我将名称更改为 zgrandson.R，R 会最后调用该文件，并且一切似乎都运行良好，但这显然不是解决问题的方法。

我已经阅读了创建包的教程，但它们似乎都处理了在 R 中没有继承/调用其他文件的简单情况。希望我已经说清楚了。

Answer 1

据我了解，您可以使用DESCRIPTION文件中的Collate字段来控制这个。

引用Writing R Extensions manual:

“整理”字段可用于控制整理顺序 处理包中的 R 代码文件时 安装。默认是根据“C”语言环境进行整理。 如果存在，则整理规范必须列出所有 R 代码文件 包（考虑到可能的特定于操作系统的子目录， 请参阅包子目录）作为空格分隔的文件列表 相对于 R 子目录的路径。包含空格的路径或 引号需要引用。特定于操作系统的排序规则字段 (‘Collat​​e.unix’ 或 ‘Collat​​e.windows’) 将被用来代替 “整理”。

所以，你可以指定：

Collate:
  father.r
  son.R
  grandson.r

或者只是重命名文件，按照您在问题中指出的那样，字典排序顺序将产生正确的排序顺序。

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但也请参阅@DirkEddelbuettel 的this answer 讨论类似问题。