【问题标题】:MLSeq package errorMLSeq 包错误
【发布时间】:2017-03-18 07:51:43
【问题描述】:

我想使用 MLSeq 包,但出现此错误。

库(MLSeq) 错误:“namespace:caret”未导出对象“bag.default” 错误:“MLSeq”的包或命名空间加载失败

我该如何克服这个错误?

sessionInfo() R 版本 3.3.1 (2016-06-21) 平台:x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit) 运行于:OS X 10.12.1 (Sierra)

输出:

语言环境:[1] en_CA.UTF-8/en_CA.UTF-8/en_CA.UTF-8/C/en_CA.UTF-8/en_CA.UTF-8

附加的基础包:[1] 并行 stats4 统计图形 grDevices utils 数据集方法库

其他附加包:[1] edgeR_3.14.0
randomForest_4.6-12 limma_3.28.21 DESeq2_1.12.4
总结实验_1.2.3 Biobase_2.32.0
GenomicRanges_1.24.3 [8] GenomeInfoDb_1.8.7
IRanges_2.6.1 S4Vectors_0.10.3
BiocGenerics_0.18.0 caret_6.0-72 ggplot2_2.1.0
lattice_0.20-34

通过命名空间加载(未附加):[1] Rcpp_0.12.7
locfit_1.5-9.1 digest_0.6.10 foreach_1.4.3
plyr_1.8.4 chron_2.3-47 acepack_1.4.1
MatrixModels_0.4-1 RSQLite_1.0.0 [10] zlibbioc_1.18.0
minqa_1.2.4 data.table_1.9.6 annotate_1.50.1
SparseM_1.72 car_2.1-3 nloptr_1.0.4
rpart_4.1-10 Matrix_1.2-7.1 [19] splines_3.3.1
lme4_1.1-12 BiocParallel_1.6.6 基因绘图仪_1.50.0
stringr_1.1.0 foreign_0.8-67 RCurl_1.95-4.8
munsell_0.4.3 mgcv_1.8-15 [28] htmltools_0.3.5
nnet_7.3-12 gridExtra_2.2.1 htmlTable_1.7
Hmisc_4.0-0 codetools_0.2-15 XML_3.98-1.4
MASS_7.3-45 bitops_1.0-6 [37] ModelMetrics_1.1.0
grid_3.3.1 nlme_3.1-128 xtable_1.8-2
gtable_0.2.0 DBI_0.5-1 magrittr_1.5
scales_0.4.0 stringi_1.1.2 [46] XVector_0.12.1
reshape2_1.4.2 基因过滤器_1.54.2 latticeExtra_0.6-28 Formula_1.2-1 RColorBrewer_1.1-2 迭代器_1.0.8
tools_3.3.1 pbkrtest_0.4-6 [55] 生存_2.40-1
AnnotationDbi_1.34.4 colorspace_1.2-7 cluster_2.0.5
knitr_1.14 quantreg_5.29

【问题讨论】:

    标签: r bioconductor


    【解决方案1】:

    错误是由于在插入符号中导入“bag.default”函数引起的。 NAMESPACE 在开发版本 1.15.1 中已修复。您可以从https://github.com/Bioconductor-mirror/MLSeq 下载源文件。随着即将发布的 1.16.0 版本,命名空间错误将在发布版本中得到修复。

    【讨论】:

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