Matlab 安装 (LD_LIBRARY_PATH) 弄乱了其他库文件

Question

我正在尝试在 Linux 机器上安装 Matlab，但设置 LD_LIBRARY_PATH（根据安装需要）会破坏其他库文件。我不是 Linux 专家，但我尝试了几件事，但无法使其正常工作。我什至联系了 Matlab 支持，将问题提升到开发团队，并且基本上被告知“哈哈糟透了”。我在网上看到其他一些人也遇到过同样的问题，但要么他们的问题从未得到解答，要么他们的问题略有不同，他们的解决方案不适用于我。

在运行 Ubuntu 的 VM 上安装：

我按照说明设置了 LD_LIBRARY_PATH，然后它会破坏网络文件。我可以 ping google.com，但我无法 nslookup google.com 或在浏览器中访问它。 Nslookup 提供此错误：

nslookup: /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v90/bin/glnxa64/libcrypto.so.1.0.0: no version information available (required by /usr/lib/libdns.so.100)
03-Feb-2016 11:32:22.361 ENGINE_by_id failed (crypto failure)
03-Feb-2016 11:32:22.362 error:25070067:DSO support routines:DSO_load:could not load the shared library:dso_lib.c:244:
03-Feb-2016 11:32:22.363 error:260B6084:engine routines:DYNAMIC_LOAD:dso not found:eng_dyn.c:447:
03-Feb-2016 11:32:22.363 error:2606A074:engine routines:ENGINE_by_id:no such engine:eng_list.c:418:id=gost
(null): dst_lib_init: crypto failure

尽管安装成功（我可以运行引用已编译 Matlab 函数的 Java 程序）。取消设置 LD_LIBRARY_PATH 修复了网络文件，但是我不能再运行程序了。

在 EC2 实例上安装：

在 EC2 实例上，它不会破坏网络文件（nslookup 很好）。相反，它会弄乱 Python 库文件。尝试使用任何 aws cli 命令，我收到错误：

File "/usr/bin/aws", line 19, in <module>
  import awscli.clidriver
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/awscli/clidriver.py", line 16, in <module>
  import botocore.session
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/botocore/session.py", line 25, in <module>
  import botocore.config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/botocore/config.py", line 18, in <module>
  from botocore.compat import six
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/botocore/compat.py", line 139, in <module>
  import xml.etree.cElementTree
File "/usr/lib64/python2.7/xml/etree/cElementTree.py", line 3, in <module>
  from _elementtree import *
ImportError: PyCapsule_Import could not import module "pyexpat"

在 Python 中打印 sys.path 显示 lib-dynload 已经存在，所以这似乎不是问题。

当尝试运行程序时，我得到：

Exception in thread "main" java.lang.LinkageError: libXt.so.6: cannot open shared object file: No such file or directory
at com.mathworks.toolbox.javabuilder.internal.DynamicLibraryUtils.dlopen(Native Method)
at com.mathworks.toolbox.javabuilder.internal.DynamicLibraryUtils.loadLibraryAndBindNativeMethods(DynamicLibraryUtils.java:134)
at com.mathworks.toolbox.javabuilder.internal.MWMCR.<clinit>(MWMCR.java:1529)
at VectorAddExample.VectorAddExampleMCRFactory.newInstance(VectorAddExampleMCRFactory.java:48)
at VectorAddExample.VectorAddExampleMCRFactory.newInstance(VectorAddExampleMCRFactory.java:59)
at VectorAddExample.VectorAddClass.<init>(VectorAddClass.java:62)
at com.mypackage.Example.main(Example.java:13)

我在砖墙上，真的不知道如何继续。

Answer 1

也许其他东西已经需要 LD_LIBRARY_PATH 设置才能工作。确保前面没有覆盖：

export LD_LIBRARY_PATH=new/path:$LD_LIBRARY_PATH

编辑：

好的，如果 LD_LIBRARY_PATH 最初是空的，这表明 Matlab 带有与您的系统不兼容的共享库：

nslookup: /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v90/bin/glnxa64/libcrypto.so.1.0.0: no version information available (required by /usr/lib/libdns.so.100)

建议/usr/lib/libdns.so.100需要libcrypto.so.1.0.0，现在正在解析为MATLAB自带的，不兼容。

您可以通过以下方式检查 dll 的依赖关系

ldd /usr/lib/libcrypto.so.1.0.0

希望您能找到一个让 MATLAB 和您的系统都满意的配置。不幸的是，这可能需要大量的试验和错误。

如果没有这样的配置，可以尝试只在运行MATLAB时设置LD_LIBRARY_PATH：

LD_LIBRARY_PATH=$MATLAB_LD_LIBRARY_PATH matlab

编辑 2：

好吧，对于 Python 问题，它似乎归结为 pyexpat，它是标准 expat XML 解析器的包装。尝试做（名字猜到了，因为我现在没有 Linux）：

ldd /usr/local/lib/python2.7/site-packages/libpyexpat.so

看看这取决于什么。可能是libexpat.so，现在正在解析为 MATLAB 的版本。

Answer 2

尝试以下命令：

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v90/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v90/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v90/sys/os‌​/glnxa64:$LD_LIBRARY_PATH

Answer 3

也许对 OP 没有帮助，但如果您使用 MATLAB 生成 python 包，您可以修改 MATLAB 为您的包创建的生成的 __init__.py 文件。

具体来说，生成的__init__.py 文件包含以下行（截至 MATLAB 2017a）：

PLATFORM_DICT = {'Windows': ['PATH','dll',''], 'Linux': ['LD_LIBRARY_PATH','so','libmw'], 'Darwin': ['DYMCR_LIBRARY_PATH','dylib','libmw']}

对于 Linux 平台，您可以简单地将 LD_LIBRARY_PATH 替换为 MCR_LIBRARY_PATH 等其他内容，以防止与您的共享库发生冲突。

sed -i -e 's/LD_LIBRARY_PATH/MCR_LIBRARY_PATH/g' /MY/PACKAGE/BUILD/PATH/__init__.py 

那么显然在使用python之前导出MCR_LIBRARY_PATH。