通过 gc() 静默释放内存答案

【问题标题】：Release memory by gc() in silence通过 gc() 静默释放内存
【发布时间】：2014-12-20 15:02:58
【问题描述】：

我在 ubuntu 中运行 R 代码并想释放一些内存。删除 (rm()) 变量后，我调用 gc()。它似乎有效。但是如何让它在沉默中工作（即不报告消息）。我尝试设置gcinfo(verbose=FALSE)，但gc() 仍然报告该消息。

gcinfo(verbose=FALSE)
# [1] FALSE
gc()
#             used  (Mb) gc trigger   (Mb)  max used   (Mb)
# Ncells    256641  13.8     467875   25.0    350000   18.7
# Vcells 103826620 792.2  287406824 2192.8 560264647 4274.5

【问题讨论】：

标签： r memory garbage-collection

【解决方案1】：

invisible() 函数对此很有用。一种方法是编写一个您自己的小 gc() 包装函数，它不带任何参数返回 gc() 不可见。

gcQuiet <- function(quiet = TRUE, ...) {
    if(quiet) invisible(gc()) else gc(...)
}

gcQuiet()        ## runs gc() invisibly

gcQuiet(FALSE)
#          used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
# Ncells 283808 15.2     531268 28.4   407500 21.8
# Vcells 505412  3.9    1031040  7.9   896071  6.9

gcQuiet(FALSE, verbose=TRUE)
# Garbage collection 26 = 12+1+13 (level 2) ... 
# 15.2 Mbytes of cons cells used (53%)
# 3.9 Mbytes of vectors used (49%)
#          used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
# Ncells 283813 15.2     531268 28.4   407500 21.8
# Vcells 505412  3.9    1031040  7.9   896071  6.9

【讨论】：

【解决方案2】：

我使用的快速而肮脏的方法：

echo "gc()" > gc.R

那么你可以这样做：

source("gc.R", echo=FALSE)

【讨论】：