【问题标题】:Is it possible to catch data streams other than stdin, stdout and stderr in a Popen call?是否可以在 Popen 调用中捕获除标准输入、标准输出和标准错误以外的数据流?
【发布时间】:2017-01-19 19:21:56
【问题描述】:

我正在将程序 (samtools) 合并到管道中。仅供参考 samtools 是一个用于操作 SAM 格式的 DNA 序列比对的程序。它通过 stdin 和 stdout 接受输入并生成输出文件,因此很容易通过 pythons subprocess.Popen() 控制。

当它运行时,它还会向控制台输出短消息 - 显然不使用标准输出 - 我想知道是否也可以捕获这些消息 - 可能通过获取 os 生成的处理程序列表?

我想我的问题一般是如果程序控制台输出不是来自标准输出,是否可以捕获它?谢谢。

【问题讨论】:

  • 你用的是什么操作系统?
  • 啊,是的,对不起。它是 Linux Fedora。
  • 如果不通过 stdout 或 stderr,消息如何到达控制台?
  • 我真的不知道。我没有看源代码。我只知道它们不是标准输出的一部分。但我必须承认,我没有检查过 stderror。将其用于非错误消息是否很常见?
  • 是的,对于所有类型的带外信息,例如进度、调试信息等。程序也有可能在新的文件描述符中打开 /dev/tty 并写入该文件,以确保尽管有任何重定向,它仍会写入终端。在这种情况下,拦截会比较棘手,因为它涉及到创建一个伪终端。

标签: python stream subprocess stdout stderr


【解决方案1】:

除了 stdout 和 stderr 没有其他控制台输出(假设 samtools 不直接通过 tty 设备写入终端)。因此,如果输出没有被子进程 stdout 捕获,那么它一定已经写入 stderr,也可以使用 Popen()stderr=subprocess.PIPE 捕获并检查生成的进程对象的 stderr 属性。

【讨论】:

  • 非常感谢 - 我也想稍微道歉。没有检查stderror,我感到有点尴尬。这确实是我问题的关键。我现在更聪明了。
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