数据表和数据框操作答案

【问题标题】：data table and data frame operations数据表和数据框操作
【发布时间】：2013-09-26 00:18:24
【问题描述】：

我正在使用一些使用数据表类而不是数据框类的 R 代码。

如何在 R 中执行以下操作而无需将 map.dt 转换为 map.df？

map.dt = data.table(chr = c("chr1","chr1","chr1","chr2"), ref = c(1,0,3200,3641), pat = c(1,3020,3022, 3642), mat = c(1,0,3021,0))
parent = "mat"
chrom = "chr1"
map.df<-as.data.frame(map.dt);
parent.block.starts<-map.df[map.df$chr == chrom & map.df[,parent] > 0,parent];

注意：父母需要动态分配，它是用户的输入。在此示例中，我选择了“垫子”，但它可以是任何列。

注意1：parent.block.starts 应该是一个整数向量。

注意 2：map.dt 是一个数据表，其中列名是 c("chr","ref","pat","mat")。

问题是在数据表中我无法按名称访问给定列，或者至少我不知道如何访问。

如果您有什么建议，请告诉我！

谢谢！

【问题讨论】：

您能否提供示例数据/可重现的示例（在这种情况下，针对对象map.dt）？
@Frank，我刚刚添加了一个简短的 map.dt 示例，谢谢！

标签： r dataframe data.table

【解决方案1】：

这里的最终目标有点不清楚，尤其是在没有示例数据的情况下，但是如果您想按字符名称访问行，有两种方法可以做到这一点：

Columns = c("A", "B")
# .. means "look up one level"
dt[,..Columns]

dt[,get("A")]
dt[,list(get("A"), get("B"))]

但如果您发现自己需要经常使用这种技术，那么您可能使用 data.table 很糟糕。

编辑

根据您的编辑，此行将返回相同的结果，无需进行任何as.data.frame 转换：

> map.dt[chr==chrom & get(parent) > 0, get(parent)]

【讨论】：

还有eval-parse路由：stackoverflow.com/questions/10675182/…
@SEnorO 谢谢！我刚刚添加了 map.dt 的示例。
@SenorO，谢谢，问题是我需要将它们作为一个角色来访问，它并不总是 mat 或 pat，它会改变。我做了 map.dt[chr == chrom & map.dt[,get(parent)] > 0,get(parent)];并且它有效，但我很想知道为什么你认为它不能很好地使用数据表......
@SenorO 我刚刚在Q中添加了一个关于父动态分配的注释。
我不认为使用 data.table 不好 - 我认为如果你发现自己一直这样做，这表明你可能没有很好地使用 data.table。