如何使用 bash 脚本在不同的文件夹中运行可执行文件？

Question

我有一个程序 a.out，它将被设置在一些文件夹序列中，每个文件夹都有一个 a.out，并会在每个文件夹中产生一些结果。我正在尝试并行执行这些相同的程序。如果我在文件夹中，我只需执行 ./a.out 即可运行。我必须在其文件夹中执行 a.out，因为 a.out 在当前目录中查找文件。因此，如果我不在其文件夹中，它将找不到该文件。

运行这些程序是另一个基于 rootDir 的作业的一部分。我正在使用 MATLAB，所以我尽量避免在 MATLAB 中使用 cd，因为每次使用 cd 时都会重新编译 MATLAB 代码并大大减慢代码速度。

我用 MATLAB 代码写了一个 CallParallel.sh，里面有这行：

for i in ${JobsOnThisNode[@]};do echo $i;done | xargs -n1 -P ${SLURM_NTASKS_PER_NODE} sh  -c '"$1"' sh;

$1 基本上为每批由 jname 和 cname 递增的并行作业获取此命令：

cd /mnt/home/thrust2/zf1005/Matlab/GAFit/RunningFolder/$jname/$cname/ && ./a.out

我已经从 rootDir 测试了这段代码，它成功地在另一个文件夹中运行了这个程序。但是，当我在 bash 脚本中执行它时，出现以下错误：

sh: /mnt/home/thrust2/zf1005/Matlab/GAFit/RunningFolder/1/1/: Is a directory
sh: &&: command not found
sh: ./a.out: No such file or directory

如果我理解正确，不知何故它无法识别 && 并且 cd 不知何故只检查它是否是一个目录，而不是实际更改到该目录，因此，在根目录。

当我尝试这个时：

sh '"cd /mnt/home/thrust2/zf1005/Matlab/GAFit/RunningFolder/1/1"'

我明白了：

sh: "cd /mnt/home/thrust2/zf1005/Matlab/GAFit/RunningFolder/1/1": No such file or directory

Answer 1

sh '"cd /mnt/home/thrust2/zf1005/Matlab/GAFit/RunningFolder/1/1"'

表示使用sh解释"cd /mnt/home/thrust2/zf1005/Matlab/GAFit/RunningFolder/1/1"，它不存在。

为了简化事情，您可以创建一个以 dir 作为参数的运行器脚本

#! /bin/bash
cd "$1" && /path/to/a.out

然后从xargs 调用runner。

顺便说一句，您只需要 1 个 a.out 而不是每个目录 1 个。