【问题标题】:Can't install R packages on Linux Mint 17无法在 Linux Mint 17 上安装 R 包
【发布时间】:2015-01-03 18:42:19
【问题描述】:

在 Linux Mint 17 上运行 R 3.1.2,当我尝试安装流行的软件包时,我得到了 non-zero exit status。示例install.packages 尝试的完整输出如下:

> install.packages("plyr")
Installing package into ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/plyr_1.8.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 393233 bytes (384 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 384 Kb

* installing *source* package ‘plyr’ ...
** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
/bin/bash: g++: command not found
make: *** [RcppExports.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package ‘plyr’
* removing ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/plyr’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpXe52Mz/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("plyr") :
  installation of package ‘plyr’ had non-zero exit status

对于我尝试安装的其他软件包(例如 ggplot2vegan),我收到的消息基本相同,但在许多情况下,它会更加冗长,因为它尝试安装依赖项但无法安装。

这似乎是一个常见的问题,但其他人似乎有 outdated softwareinsufficient memory。我正在运行 Mint 和 R 的最新稳定版本,并且我有足够的 RAM 和交换文件,所以我认为这些都不会导致我的问题。

【问题讨论】:

    标签: linux r linux-mint


    【解决方案1】:

    根据错误信息

     /bin/bash: g++: command not found
    

    您需要安装 C++ 编译器。我将从以下之一开始:

     sudo apt-get install build-essentials        # key tools
    

     sudo apt-get install r-base-dev              # many development tools for R
    

    当然

     sudo apt-get install r-cran-rcpp             # to not install from source
    

    虽然您获得的 Rcpp 可能比您需要的旧。

    有一个r-sig-debian 列表供基于 Debian 的系统的用户使用。

    【讨论】:

    • 非常感谢潜在的未来读者,sudo apt-get install r-base-dev 为我解决了问题。
    • 很好的答案@DirkEddelbuettel!
    【解决方案2】:

    就我而言,我正在运行一个相当新的 Mint 18 安装,但我缺少某些软件包。根据 R 中的错​​误消息,我尝试安装“readr”,但由于缺少底层包“libcurl4-openssl-dev”,因此无法安装。我很容易理解,然后 readr install 没有错误,现在我的 RStudio 包按预期加载。

    【讨论】:

      【解决方案3】:

      您应该在1 测试哪个存储库适用于您的 Linux 发行版。尝试一一添加到您的“/etc/apt/sources.list”并运行:
      sudo apt 更新
      sudo apt install r-base
      在 Linux Mint 18.3 上,它适用于:
      deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/

      deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran40/

      【讨论】:

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