如何将 Dicom 数据加载到简单的 ITK 中答案

【问题标题】：How to load Dicom data into simple ITK如何将 Dicom 数据加载到简单的 ITK 中
【发布时间】：2021-10-25 22:25:06
【问题描述】：

我尝试加载 PET/CT 数据（文件夹在 https://wwsi365-my.sharepoint.com/:f:/g/personal/s9956jm_ms_wwsi_edu_pl/EkoL7bs8rvxLq7-YHminlA0Bhc0PBY5_rG3zwMI2coHUAQ?e=TuekJa 中可用） - 例如，文件可以通过切片器打开，因此不会损坏，但是当我尝试在下面的 python 代码中通过 simpleitk 加载它时 - 我收到错误

代码

 dirOfExample
="C:\\Users\\1\\Downloads\\bad45Y\\bad45Y\\DICOM\\21071306"
    reader = sitk.ImageSeriesReader()
    dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dirOfExample)
    reader.SetFileNames(dicom_names)

错误

WARNING: In D:\a\1\sitk-build\ITK\Modules\IO\GDCM\src\itkGDCMSeriesFileNames.cxx, line 113

GDCMSeriesFileNames (00000000679B0CC0): No Series can be found, make sure your restrictions are not too strong

感谢您的帮助！

【问题讨论】：

我对 simpleitk 不熟悉，但快速浏览一下，看起来 SetFileNames() 正在请求一组文件名，而不仅仅是一个文件。也许您可以尝试 SetFileName() 代替？

标签： dicom simpleitk

【解决方案1】：

您的 DICOM 文件似乎位于“21071306”的某些子目录中。 SimpleITK ImageSeriesReader 只会在您提供的目录中查找 DICOM 图像文件。它不会对子目录进行递归搜索。

【讨论】：