使用 grep/sed/perl 在单行中提取多个项目答案

【问题标题】：extract multiple items on single line using grep/sed/perl使用 grep/sed/perl 在单行中提取多个项目
【发布时间】：2018-02-08 17:32:53
【问题描述】：

我有一个有点像这样的大文本文件：

=?accession=P12345;=?position=999;
=?accession=Q19283;=?position=777;
=?accession=A918282;=?position=888;

我想提取accession= 和; 之间的术语，然后还要提取position= 和; 之间的术语

所以我得到：

P12345 999
Q19283 777
A918282 888

我需要在它们之间进行 grep 的字符串变得更加复杂，所以我想一个硬编码的解决方案。

我知道我可以采用“两个字符串之间的 grep”方法：

grep -Po 'accession= \K.*(?= ;)'

但我不知道如何从输入的同一行获取后续提取，以便与输出出现在同一行。

我真的不介意这是如何完成的，只要我可以从 linux 命令行调用它。

谢谢。

【问题讨论】：

如果您向我们展示的样本只是a bit like 您的真实数据，我们如何帮助您想出一个脚本来解析您的数据？这感觉就像我们要剥洋葱一段时间才能达到您的真正要求。

【解决方案1】：

这个awk 应该可以工作：

awk -F ';' '{gsub(/=[^=]*=/, ""); $1=$1} 1' file

P12345 999
Q19283 777
A918282 888

【讨论】：

【解决方案2】：

sed -r 's/.*accession=([^;]*);.*position=([^;]*).*/\1 \2/' textfile

【讨论】：

【解决方案3】：

这个 perl 单行代码

perl -wnE'say join " ", /(?:accession|position)=([^;]+)/g' input.txt

打印所需的输出。

【讨论】：

【解决方案4】：

您可以像这样更新您的 grep 表达式。

grep -oP "(accession=\K\w+)|(position=\K\d+)" file

输出：

要按照您想要的方式格式化，请使用paste：

grep -oP "(accession=\K\w+)|(position=\K\d+)" file | paste -d ' ' - -

输出：

P12345 999
Q19283 777
A918282 888

另一个简单的 awk 解决方案：

awk -F"=|;" '{print $3, $6}' file

输出：

P12345 999
Q19283 777
A918282 888

【讨论】：

@brucezepplin：您可以按照此处所述稍微修改您的 grep。干杯！
非常感谢 - 粘贴命令是关键，\K\w+ 很简洁。谢谢。
很高兴我能帮上忙。 :) 欢迎 ^_^
太棒了！为了使它成为一个更强有力的答案，可能会考虑在粘贴命令周围添加一些解释（是的，人们可以通过 rtfm 来理解为什么两个连字符，但可以在此处包含该信息以节省额外的谷歌搜索:)）