使用带有行名和列名的 fread 读取文件答案

【问题标题】：reading file using fread with row and column names使用带有行名和列名的 fread 读取文件
【发布时间】：2014-09-30 19:02:11
【问题描述】：

使用 fread，如何读取包含行名和列名的 CSV 文件。我尝试了以下操作，但它没有正确读取行名和列名。

csv 文件看起来像（其中 C1、C2、C3 是列名，r1、r2、r3 是行名）

input = ",C1,C2,C3
r1,A,B,C
r2,1,3,5
3,2,4,6"

我使用函数

require(data.table)
fread(input,header = TRUE)

给

   r1 A B C
1: r2 1 3 5
2:  3 2 4 6

如何使用 fread 正确读取 CSV？

【问题讨论】：

您是否尝试在使用read.csv时添加row.names = 1？如果没有，你应该看看?read.csv
@EricFail - 对不起，我是 R/data.table 的新手。它与 read.csv 有什么关系？
看看this SO tread。
我想使用 fread 因为我的数据文件很大，我不想使用 read.csv 。
这似乎已在 v1.9.3.. 中修复。

标签： r csv data.table

【解决方案1】：

您应该提交错误报告。

这是一个解决方法：

colnames <- strsplit(readLines(textConnection(input), n=1), ",")[[1]]
colnames[1] <- "rownames"
setnames(DT <- fread(input, skip=1, header=FALSE), colnames)
DT
#   rownames C1 C2 C3
#1:       r1  A  B  C
#2:       r2  1  3  5
#3:        3  2  4  6

您应该知道，data.table 不支持行名。

【讨论】：

@d.putto，想知道在这种情况下fread() 是否仍然更快。
@EricFail 当然，它适用于相当大的文件。您似乎对fread（和data.table）了解不多。
我没有。直到 50 分钟前我才听说fread。我是来学习的。谢谢。