尝试安装 R 包时出现“ld：警告：找不到目录”答案

【问题标题】："ld: Warning: directory not found" when attempting to install R package尝试安装 R 包时出现“ld：警告：找不到目录”
【发布时间】：2019-02-17 10:24:39
【问题描述】：

我目前在运行 El Cap 10.11.6 的 Mac 上尝试在 R Studio 中安装“robustbase”包并遇到以下错误：

    ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0'
    ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib'
    ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0'
    ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib'
    ld: library not found for -lgfortran
    clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
    make: *** [robustbase.so] Error 1
    ERROR: compilation failed for package ‘robustbase’
    * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/robustbase’

我四处寻找可能的解决方案，并在this thread 中看到我可能需要修改 R/makevars 文件。

这是正确的解决方案吗？如果是这样，我在哪里修改这个文件，在我的终端？这超出了我对 R 和代码的基本知识，因此不胜感激。

如果有任何其他信息有帮助，请告诉我！

【问题讨论】：

标签： r macos compiler-errors package failed-installation

【解决方案1】：

您运行的似乎是过时版本的R。您应该安装最新版本。以下内容仅适用于最新版本的R。

您似乎没有安装 Fortran 编译器。您可以在此页面 tools 上从 CRAN 获取它。您可能还需要安装同一页面上提供的 clang6 编译器。

如果你这样做，你应该添加这个

/usr/local/clang6/bin

到 PATH 的开头。您应该检查 /usr/local/bin 是否在您的路径中，以使 gfortran 编译器可访问。

您还应该将这些行添加到您的~/.R/Makevars。

CC=/usr/local/clang6/bin/clang
CXX=/usr/local/clang6/bin/clang++
LDFLAGS =-L/usr/local/clang6/lib

【讨论】：

【解决方案2】：

在 macOS 15 Catalina 中，我遇到了类似的错误： ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0'。那是因为我从另一个安装中复制粘贴了.R/Makevars。

我使用了这个 Makevars 配置的 macOS Catalina 的修复：

XCBASE=/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk
LLVMBASE=/usr/local/opt/llvm
GETTEXT=/usr/local/opt/gettext
GCCBASE=/usr/local/opt/gcc
LIBOMP=/usr/local/opt/libomp

# brew gcc: start
CC=$(LLVMBASE)/bin/clang
CXX=$(LLVMBASE)/bin/clang++
CXX11=$(LLVMBASE)/bin/clang++
CXX14=$(LLVMBASE)/bin/clang++
CXX17=$(LLVMBASE)/bin/clang++
CXX1X=$(LLVMBASE)/bin/clang++
# brew gcc: end

CPPFLAGS=-isystem "$(LLVMBASE)/include" -isysroot "$(XCBASE)"
LDFLAGS=-L"$(LLVMBASE)/lib" -L"$(GETTEXT)/lib" --sysroot="$(XCBASE)"

FC=$(GCCBASE)/bin/gfortran
F77=$(GCCBASE)/bin/gfortran

FLIBS=-L$(GCCBASE)/lib/gcc/9/ -lm

有了这个Makevars，我已经能够从源代码构建这些 R 包：data.table、sf、devtools、RcppArmadillo、psych、tmvnsim、gower 和许多其他人。

【讨论】：