【发布时间】:2017-05-21 00:08:01
【问题描述】:
我在一个我没有权限的集群上,我正在尝试pip install mpi4py。由于我无法安装python3-devel 包,所以我下载了它并将其放在~/.local/ 中。不管这是否有成功的机会,以下让我感到困惑。
如果我只是运行pip3.4 install --user mpi4py,我会遇到这个错误:
/opt/sgi/mpt/mpt-2.14/bin/mpicc -pthread -Wno-unused-result -Werror=declaration-after-statement -DNDEBUG -fmessage-length=0 -grecord-gcc-switches -fstack-protector -O2 -Wall -D_FORTIFY_SOURCE=2 -funwind-tables -fasynchronous-unwind-tables -g -DOPENSSL_LOAD_CONF -fPIC -DHAVE_CONFIG_H=1 -DHAVE_DLFCN_H=1 -DHAVE_DLOPEN=1 -I~/.local/include/python3.4m/ -I/usr/include/python3.4m -c src/MPI.c -o build/temp.linux-x86_64-3.4/src/MPI.o
In file included from src/MPI.c:4:0:
src/mpi4py.MPI.c:4:20: fatal error: Python.h: No such file or directory
#include "Python.h"
所以我想我需要通知pip 这个标题的位置。我试着这样做
pip3.4 install --user --global-option=build_ext --global-option="-I~/.local/include/python3.4m/" mpi4py
但我仍然收到相同的错误 (??)。我还尝试在没有全局选项的命令前添加 CPATH=$CPATH:~/.local/include/python3.4m 前缀,但无济于事。
pip 怎么会直接忽略包含路径?
服务器是某种 Suse Linux Enterprise。
更新:我发现路径必须是绝对的,但在链接阶段出现同样的问题:
ls ~/.local/lib64/
libpython3.4m.so libpython3.so pkgconfig
所以我将--global-option="-L$HOME/.local/lib64/" 添加到pip 命令中,然后:
/opt/sgi/mpt/mpt-2.14/bin/mpicc -pthread _configtest.o -L/home/student/n/name/.local/lib64/ -Lbuild/temp.linux-x86_64-3.4 -lpython3.4m -o _configtest
/usr/lib64/gcc/x86_64-suse-linux/4.8/../../../../x86_64-suse-linux/bin/ld: cannot find -lpython3.4m
collect2: error: ld returned 1 exit status
failure.
removing: _configtest.c _configtest.o
error: Cannot link MPI programs. Check your configuration!!!
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所以添加了库路径,-l<libname> 匹配但它没有链接。看来,libpython3.4m.so 实际上是我找不到的libpython3.4m.so.1.0 的符号链接。也许这就是问题所在,因为我手动安装python3-devel 并没有安装一些依赖项。
【问题讨论】:
标签: python compiler-errors pip environment-variables mpi