A = np.arange(40).reshape(4,10)*.1
startend = [[2,5],[3,6],[4,7],[5,8]]
index_list = [np.arange(v[0],v[1]) + i*A.shape[1]
for i,v in enumerate(startend)]
# [array([2, 3, 4]), array([13, 14, 15]), array([24, 25, 26]), array([35, 36, 37])]
A.flat[index_list]
生产
array([[ 0.2, 0.3, 0.4],
[ 1.3, 1.4, 1.5],
[ 2.4, 2.5, 2.6],
[ 3.5, 3.6, 3.7]])
这仍然有一个迭代,但它是一个列表中相当基本的迭代。
我正在索引A 的扁平化 1d 版本。 np.take(A, index_list) 也可以。
如果行间隔大小不同,我可以使用np.r_ 连接它们。这不是绝对必要的,但在从多个区间和值构建索引时会很方便。
A.flat[np.r_[tuple(index_list)]]
# array([ 0.2, 0.3, 0.4, 1.3, 1.4, 1.5, 2.4, 2.5, 2.6, 3.5, 3.6, 3.7])
ajcr使用的idx可以不用choose:
idx = [np.arange(v[0], v[1]) for i,v in enumerate(startend)]
A[np.arange(A.shape[0])[:,None], idx]
idx 和我的index_list 一样,只是它不增加行长。
np.array(idx)
array([[2, 3, 4],
[3, 4, 5],
[4, 5, 6],
[5, 6, 7]])
由于每个arange的长度相同,所以idx无需迭代即可生成:
col_start = np.array([2,3,4,5])
idx = col_start[:,None] + np.arange(3)
第一个索引是一个列数组,它广播以匹配这个idx。
np.arange(A.shape[0])[:,None]
array([[0],
[1],
[2],
[3]])
有了这个A 和idx,我得到了以下时间:
In [515]: timeit np.choose(idx,A.T[:,:,None])
10000 loops, best of 3: 30.8 µs per loop
In [516]: timeit A[np.arange(A.shape[0])[:,None],idx]
100000 loops, best of 3: 10.8 µs per loop
In [517]: timeit A.flat[idx+np.arange(A.shape[0])[:,None]*A.shape[1]]
10000 loops, best of 3: 24.9 µs per loop
flat 索引更快,但计算更高级的索引需要一些时间。
对于大型数组,flat 索引的速度占主导地位。
A=np.arange(4000).reshape(40,100)*.1
col_start=np.arange(20,60)
idx=col_start[:,None]+np.arange(30)
In [536]: timeit A[np.arange(A.shape[0])[:,None],idx]
10000 loops, best of 3: 108 µs per loop
In [537]: timeit A.flat[idx+np.arange(A.shape[0])[:,None]*A.shape[1]]
10000 loops, best of 3: 59.4 µs per loop
np.choose 方法遇到硬编码限制:Need between 2 and (32) array objects (inclusive).
什么越界idx?
col_start=np.array([2,4,6,8])
idx=col_start[:,None]+np.arange(3)
A[np.arange(A.shape[0])[:,None], idx]
产生错误,因为最后一个 idx 值是 10,太大。
你可以clipidx
idx=idx.clip(0,A.shape[1]-1)
在最后一行产生重复值
[ 3.8, 3.9, 3.9]
您也可以在索引之前填充A。更多选项请参见np.pad。
np.pad(A,((0,0),(0,2)),'edge')[np.arange(A.shape[0])[:,None], idx]
另一种选择是删除超出范围的值。然后idx 将变成一个参差不齐的列表列表(或列表数组)。 flat 方法可以处理这个问题,但结果不会是矩阵。
startend = [[2,5],[4,7],[6,9],[8,10]]
index_list = [np.arange(v[0],v[1]) + i*A.shape[1]
for i,v in enumerate(startend)]
# [array([2, 3, 4]), array([14, 15, 16]), array([26, 27, 28]), array([38, 39])]
A.flat[np.r_[tuple(index_list)]]
# array([ 0.2, 0.3, 0.4, 1.4, 1.5, 1.6, 2.6, 2.7, 2.8, 3.8, 3.9])