测试 Netezza UDX 时出现未定义符号错误答案

【问题标题】：Undefined symbol error when testing Netezza UDX测试 Netezza UDX 时出现未定义符号错误
【发布时间】：2014-05-22 05:40:08
【问题描述】：

我正在尝试通过 Rserve 实现使用 R language 的 Netezza UDX（因此我使用 C++ 的 Rconnection 库）。目前，我只编写了 UDX 运行所需的最低要求。

如下所示：

#define MAIN

// Netezza UDX libraries
#include "udxinc.h"
#include "udxhelpers.h"

// C++ libraries
#include <cstdlib>
#include <cstring>

// external Rserve and R headers
#include "Rconnection.h"
#include "sisocks.h"

using namespace nz::udx::dthelpers;
using namespace nz::udx_ver2;

// extends UDF base class
class My_UDX : public Udf {     

    public:
        Rconnection * rc;

        My_UDX(UdxInit *pInit) : Udf(pInit) {
            initsocks();
            // IP address in place of ...
            rc = new Rconnection("...", 6311);
        };

        ~My_UDX() {
            delete rc;
        }

        static Udf* instantiate(UdxInit *pInit);

        virtual ReturnValue evaluate();
};

Udf* My_UDX::instantiate(UdxInit *pInit) {
    return new My_UDX(pInit);
}

// called once for each row of data during execution
ReturnValue My_UDX::evaluate() {

    int32 retval = 15;

    NZ_UDX_RETURN_INT32(retval);
}

当我尝试使用 SQL 查询测试 UDX 时出现问题。我的查询如下所示：

SELECT * FROM table_name WHERE My_UDX(table_field) = 1;

这是我收到的错误消息：

Testing...
nzsql -d database_name -u my_username -pw my_password -f sql/test.sql
nzsql:sql/test.sql:1: ERROR:  /dev/shm/spuplans/63_1_3.o: undefined symbol: _ZN11RconnectionC1EPKci : loading executable code
make: *** [update] Error 2

如果我删除 Rconnection 对象，UDX 就可以正常工作。

我查看了有关 Netezza UDX、Rserve 和 Rconnection 的不同手册，但没有任何结果。找不到对此错误的任何解释以及可以采取的解决方法。

然后我认为编译过程可能有问题，包含所需的库和标志。我对makefile不太熟悉，所以这是很有可能的。我的 makefile 看起来像这样：

# list of files
function_name   = My_UDX
object_files    = $(function_name).o_x86
spu_files       = $(function_name).o_spu10

# database connection
db_call = nzsql -d database_name -u my_username -pw my_password -f

# path to directories
lib_dir             = /home/nz/libs
r_connection_dir    = /home/nz/Rconnection

all: update

update: compile
    $(db_call) sql/unload.sql
    cp $(object_files) $(lib_dir)
    cp $(spu_files) $(lib_dir)
    rm -f *.o_spu10 *.o_x86
    $(db_call) sql/create.sql
    $(db_call) sql/test.sql

compile:
    nzudxcompile $(function_name).cpp --args -I$(r_connection_dir)

unload.sql 只是删除之前加载的函数，而 create.sql 只是创建它。只有在执行带有前面显示的 SQL 查询的 test.sql 时才会出现问题。

已经尝试解决这个问题很长一段时间，所以任何帮助都将不胜感激！

【问题讨论】：

您是否有理由使用 Rserve 而不是按照 IBM 的建议在 Netezza 上安装 R？对于您的问题，如果您使用的是共享库，则必须使用 CREATE OR REPLACE LIBRARY 安装它，否则您的 UDX 将看不到它。
因为我们在不同的服务器上安装了 Rserve，而这正是我被分配尝试的。您对共享库的看法是正确的。

标签： undefined symbols netezza

【解决方案1】：

如上所述，Rconnection 必须作为共享库加载或与 UDF 一起编译。通过使用 UDF 编译解决了这个问题。

# for host environment
nzudxcompile --host Rconnection.cpp -o temp_rconnection.o_x86
nzudxcompile --host myudf.cpp -o temp_myudf.o_x86
nzudxcompile --host --objs temp_rconnection.o_x86 --objs temp_myudf.o_x86 -o myudf.o_x86

# for spu environment
nzudxcompile Rconnection.cpp --spu -o temp_rconnection.o_spu10
nzudxcompile myudf.cpp --spu -o temp_myudf.o_spu10
nzudxcompile --spu --objs temp_rconnection.o_spu10 --objs temp_myudf.o_spu10 -o    myudf.o_spu10

【讨论】：