Python：制作多个 bash 脚本的脚本

Question

我有一个文件，叫做 list.txt，它是文件名的列表：

input1.txt
input2.txt
input3.txt

我想构建一个 python 脚本，为每个文件名创建一个文件。更准确地说，我需要它来打印一些文本、合并文件名并将其保存到一个唯一的 .sh 文件中。我的脚本如下：

import os
os.chdir("/Users/user/Desktop/Folder")

with open('list2.txt','r') as f:    
    lines = f.read().split(' ')

for l in lines:
    print "#!/bin/bash\n#BSUB -J",l+".sh","\n#BSUB -o /scratch/DBC/user/"+l+".sh.out\n#BSUB -e /scratch/DBC/user/"+l+".sh.err\n#BSUB -n 1\n#BSUB -q normal\n#BSUB -P DBCDOBZAK\n#BSUB -W 168:00\n"
    print "cd /scratch/DBC/user\n"
    print 'grep "input"',l+" > result."+l+".txt"

    with open('script{}.sh'.format(l), 'w') as output:
        output.write(l)

我有几个问题：

• 输出文件只包含文件名，而不是我打印的内容。

要清楚我的输出文件（我应该有 3 个）应该是这样的：

#!/bin/bash
#BSUB -J input3.sh 
#BSUB -o /scratch/DBC/user/input1.sh.out
#BSUB -e /scratch/DBC/user/input3.sh.err
#BSUB -n 1
#BSUB -q normal
#BSUB -P DBCDOBZAK
#BSUB -W 168:00

cd /scratch/DBC/user
grep "input" input3 > result.input3.txt

我对 Python 很陌生，所以我假设可能有更简单的方法来打印和插入我的文本。任何帮助将不胜感激。

更新 我现在制作了以下脚本，几乎可以正常工作。

import os
os.chdir("/Users/user/Desktop/Folder")

with open('list.txt','r') as f:
    lines = f.read().split('\n')

for l in lines:
    header = "#!/bin/bash \n#BSUB -J %s.sh \n#BSUB -o /scratch/DBC/user/%s.sh.out \n#BSUB -e /scratch/DBC/user/%s.sh.err \n#BSUB -n 1 \n#BSUB -q normal \n#BSUB -P DBCDOBZAK \n#BSUB -W 168:00\n"%(l,l,l)
    script = "cd /scratch/DBC/user\n"
    script2 = 'grep "input" %s > result.%s.txt\n'%(l,l)
    all= "\n".join([header,script,script2])

    with open('script_{}.sh'.format(l), 'w') as output:
        output.write(all)

我仍然遇到的问题是，这会创建 4 个脚本，而不是我预期的 3 个：script_input1.sh、script_input2.sh、script_input3.sh 和 script_sh。最后一个，script_sh 只有打印的文本，但没有“输入”文本所在的位置。我认为这是因为我的 list.txt 文件末尾有一个“\n”？但是，我看了，确实没有。有没有解决的办法？也许我可以使用某种长度函数？

Answer 1

另一种解决方案，而不是创建文件

script1.sh
script2.sh
script3.sh

等等。将是创建一个文件文件script.sh

#!/bin/bash
#BSUB -J "$1".sh 
#BSUB -o /scratch/DBC/user/"$1".sh.out
#BSUB -e /scratch/DBC/user/"$1".sh.err
#BSUB -n 1
#BSUB -q normal
#BSUB -P DBCDOBZAK
#BSUB -W 168:00

cd /scratch/DBC/user
grep "input" "$1" > result."$1".txt

并使用

运行它

script.sh input1
script.sh input2
script.sh input3

Answer 2

所以，按顺序回答：

1) 你能详细说明这个问题吗？你算了 4 个 txt 文件，但你的代码只生成了 3 个不同的脚本？

2) 当然，您需要创建一个 var，而不仅仅是使用 print 语句 3）只需更改权限

所以，总结一下，我会使用这种方法：

import os
for i, file in enumerate(os.listdir("/Users/user/Desktop/Folder")):
  if "input" in file:
    with open(file) as f:
        lines = f.readlines()

        for l in lines:
            data = ""
            data += "#!/bin/bash\n#BSUB -J",l+".sh","\n#BSUB -o /scratch/DBC/user/"+l+".sh.out\n#BSUB -e /scratch/DBC/user/"+l+".sh.err\n#BSUB -n 1\n#BSUB -q normal\n#BSUB -P DBCDOBZAK\n#BSUB -W 168:00\n"
            data += "cd /scratch/DBC/user\n"
            data += 'grep "input"'+l+" > result."+l+".txt"

            with open('script%s.sh'%i, 'w') as output:
                output.write(data)
            os.chmod("script%s.sh'%i", 700)

顺便说一句，我的代码只是一个猜测。我认为您在说明您的问题时应该更加明确。我不明白你想要实现什么。