如何编写一个 for 循环来解析 R 中的三个不同变量？

Question

我很难编写一个 for 循环来解析三个不同的列以进行进一步的绘图。

例如，

我的表格有 3 个不同的列/变量，每个变量有 4 种不同的类型

 colnames    cells         genes       treatment    survival days
    1         a            a2           a3
    2         b            b2           b3
    3         c            c2           c3
    4         d            d2           d3

最后，我想绘制生存曲线，例如：

ggsurvplot(survival days, status)~ cells+genes+treatment, data)

如何使用 for 循环来确保可以绘制所有组合：

1. cells a + gene a2+ treatment a3
2. cells a + gene b2 + treatment a3 
etc.al

它应该有64个组合，所以很多情节。

谢谢。

Answer 1

试试这个：

cells<-c("a","b","c","d")
genes<-c("a2","b2","c2","d2")
treatment<-c("a3","b3","c3","d3")
mydf<-data.frame(cells=cells,genes=genes,treatment=treatment)
expand.grid(mydf)

预期输出

> tail(expand.grid(mydf))
   cells genes treatment
59     c    c2        d3
60     d    c2        d3
61     a    d2        d3
62     b    d2        d3
63     c    d2        d3
64     d    d2        d3

如果你需要处理重复：

cells<-c("a","b","b","b")
genes<-c("a2","a2","a2","b2")
treatment<-c("a3","c3","c3","c3")
mydf<-data.frame(cells=cells,genes=genes,treatment=treatment)
expand.grid(unique(mydf$cells),unique(mydf$genes),unique(mydf$treatment))

结果：

  Var1 Var2 Var3
1    a   a2   a3
2    b   a2   a3
3    a   b2   a3
4    b   b2   a3
5    a   a2   c3
6    b   a2   c3
7    a   b2   c3
8    b   b2   c3