conda更新后，使用matplotlib时python内核崩溃

Question

我用conda 创建了这个简单的环境：

conda create -n test python=3.8.5 pandas scipy numpy matplotlib seaborn jupyterlab

jupyter lab 中的以下代码使内核崩溃：

import matplotlib.pyplot as plt

plt.subplot()

我在Linux 上没有遇到问题。问题是当我尝试Windows 10。

jupyter lab 控制台（我启动服务器的地方）上没有错误，我不知道在哪里进行调查。

Answer 1

2021 年 11 月 6 日更新

• 根据main / packages / freetype，conda 的默认 pkgs/main 频道已恢复为在 Windows 上使用 freetype 2.10.4。
• 如果您仍然遇到问题，请使用conda list freetype 检查版本：freetype != 2.11.0
  • 如果是 2.11.0，则根据解决方案更改版本，或 conda update --all（前提是您的默认频道未在 .condarc 配置文件中更改）。

解决方案

• 如果在安装 Anaconda 后出现这种情况，请自 2021 年 10 月 27 日起更新 conda 或 freetype。
• 在任何受影响的环境中转到Anaconda 提示并降级freetype 2.11.0。
  • conda install freetype=2.10.4
• 与使用matplotlib 的任何包和任何IDE 相关
  • 例如，pandas.DataFrame.plot 和 seaborn
  • Jupyter、Spyder、VSCode、PyCharm、命令行。

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发现

• 使用来自 conda（10 月 29 日星期五发布）的最新更新进行更新后出现问题。
• 使用conda update --all 更新后，任何IDE 中与matplotlib 相关的任何内容都会出现问题（不仅仅是Jupyter）。
  • 我在命令提示符下在JupyterLab、PyCharm 和python 中对此进行了测试。
  • PyCharm：Process finished with exit code -1073741819
  • JupyterLab：内核刚刚重新启动，没有相关的错误或 Traceback
  • 命令提示：会短暂出现一个空白的交互式matplotlib窗口，然后出现一个新的命令行。
• 问题似乎在于conda update --all in (base)，然后任何使用matplotlib（例如seaborn 和pandas.DataFrame.plot）的绘图API 都会在任何环境中杀死内核。
• 我不得不重新安装 Anaconda，但不要更新 (base)，然后我的其他环境就可以工作了。
• 我还没有弄清楚具体是什么导致了这个问题。
• 我用python 3.8.12 和python 3.9.7 测试了这个问题
• 当前测试：
  • 以下是conda 修订日志。
  • 在 conda update --all 之前，此环境可以正常工作，但在更新之后，使用 matplotlib 绘图会使 python 内核崩溃

  2021-10-31 10:47:22  (rev 3)
     bokeh  {2.3.3 (defaults/win-64) -> 2.4.1 (defaults/win-64)}
     click  {8.0.1 (defaults/noarch) -> 8.0.3 (defaults/noarch)}
     filelock  {3.0.12 (defaults/noarch) -> 3.3.1 (defaults/noarch)}
     freetype  {2.10.4 (defaults/win-64) -> 2.11.0 (defaults/win-64)}
     imagecodecs  {2021.6.8 (defaults/win-64) -> 2021.8.26 (defaults/win-64)}
     joblib  {1.0.1 (defaults/noarch) -> 1.1.0 (defaults/noarch)}
     lerc  {2.2.1 (defaults/win-64) -> 3.0 (defaults/win-64)}
     more-itertools  {8.8.0 (defaults/noarch) -> 8.10.0 (defaults/noarch)}
     pyopenssl  {20.0.1 (defaults/noarch) -> 21.0.0 (defaults/noarch)}
     scikit-learn  {0.24.2 (defaults/win-64) -> 1.0.1 (defaults/win-64)}
     statsmodels  {0.12.2 (defaults/win-64) -> 0.13.0 (defaults/win-64)}
     sympy  {1.8 (defaults/win-64) -> 1.9 (defaults/win-64)}
     tqdm  {4.62.2 (defaults/noarch) -> 4.62.3 (defaults/noarch)}
     xlwings  {0.24.7 (defaults/win-64) -> 0.24.9 (defaults/win-64)}

• 问题似乎是freetype
  • 从2.11.0 降级到2.10.4 解决了这个问题并使环境与matplotlib 一起工作
• 去发布错误报告，发现有[Bug]: Matplotlib crashes Python #21511

Answer 2

我遇到了同样的问题，经过大量调查和故障排除后，修复非常简单：

conda update -c anaconda numpy

conda upgrade -c conda-forge matplotlib

之后它运行良好，我的视觉效果没有问题。