如何删除 matplotlib.pyplot 中子图之间的空间？

Question

我正在做一个项目，我需要将一个 10 行和 3 列的绘图网格放在一起。虽然我已经能够制作情节并安排子情节，但我无法制作一个没有空白的漂亮情节，例如下面来自gridspec documentatation. 的这个。

我尝试了以下帖子，但仍然无法完全删除示例图像中的空白。有人可以给我一些指导吗？谢谢！

• Matplotlib different size subplots
• how to remove “empty” space between subplots?

这是我的图片：

下面是我的代码。 The full script is here on GitHub。 注意：images_2 和 images_fool 都是形状为 (1032, 10) 的扁平图像的 numpy 数组，而 delta 是形状为 (28, 28) 的图像数组。

def plot_im(array=None, ind=0):
    """A function to plot the image given a images matrix, type of the matrix: \
    either original or fool, and the order of images in the matrix"""
    img_reshaped = array[ind, :].reshape((28, 28))
    imgplot = plt.imshow(img_reshaped)

# Output as a grid of 10 rows and 3 cols with first column being original, second being
# delta and third column being adversaril
nrow = 10
ncol = 3
n = 0

from matplotlib import gridspec
fig = plt.figure(figsize=(30, 30)) 
gs = gridspec.GridSpec(nrow, ncol, width_ratios=[1, 1, 1]) 

for row in range(nrow):
    for col in range(ncol):
        plt.subplot(gs[n])
        if col == 0:
            #plt.subplot(nrow, ncol, n)
            plot_im(array=images_2, ind=row)
        elif col == 1:
            #plt.subplot(nrow, ncol, n)
            plt.imshow(w_delta)
        else:
            #plt.subplot(nrow, ncol, n)
            plot_im(array=images_fool, ind=row)
        n += 1

plt.tight_layout()
#plt.show()
plt.savefig('grid_figure.pdf')

Answer 1

尝试将这一行添加到您的代码中：

fig.subplots_adjust(wspace=0, hspace=0)

对于每一个轴对象集：

ax.set_xticklabels([])
ax.set_yticklabels([])

Answer 2

开头的注释：如果您想完全控制间距，请避免使用plt.tight_layout()，因为它会尝试将图中的图排列成均匀且均匀分布。这大部分都很好并且产生了令人愉快的结果，但可以随意调整间距。

您从 Matplotlib 示例库中引用的 GridSpec 示例运行良好的原因是子图的方面没有预定义。也就是说，子图将简单地在网格上展开，并让设置的间距（在本例中为 wspace=0.0, hspace=0.0）与图形大小无关。

与此相反，您使用imshow 绘制图像，并且图像的纵横比默认设置为相等（相当于ax.set_aspect("equal")）。也就是说，您当然可以将set_aspect("auto") 添加到每个绘图（并另外添加wspace=0.0, hspace=0.0 作为 GridSpec 的参数，如画廊示例中所示），这将生成一个没有间距的绘图。

但是，在使用图像时，保持相同的纵横比是很有意义的，这样每个像素都一样宽，并且正方形阵列显示为正方形图像。
然后你需要做的是使用图像大小和图形边距来获得预期的结果。 figure 的 figsize 参数是以英寸为单位的图形（宽度，高度），这里可以使用两个数字的比率。并且可以手动调整子图参数wspace, hspace, top, bottom, left 以获得所需的结果。 下面是一个例子：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import gridspec

nrow = 10
ncol = 3

fig = plt.figure(figsize=(4, 10)) 

gs = gridspec.GridSpec(nrow, ncol, width_ratios=[1, 1, 1],
         wspace=0.0, hspace=0.0, top=0.95, bottom=0.05, left=0.17, right=0.845) 

for i in range(10):
    for j in range(3):
        im = np.random.rand(28,28)
        ax= plt.subplot(gs[i,j])
        ax.imshow(im)
        ax.set_xticklabels([])
        ax.set_yticklabels([])

#plt.tight_layout() # do not use this!!
plt.show()

编辑：
不必手动调整参数当然是可取的。因此可以根据行数和列数计算出一些最佳值。

nrow = 7
ncol = 7

fig = plt.figure(figsize=(ncol+1, nrow+1)) 

gs = gridspec.GridSpec(nrow, ncol,
         wspace=0.0, hspace=0.0, 
         top=1.-0.5/(nrow+1), bottom=0.5/(nrow+1), 
         left=0.5/(ncol+1), right=1-0.5/(ncol+1)) 

for i in range(nrow):
    for j in range(ncol):
        im = np.random.rand(28,28)
        ax= plt.subplot(gs[i,j])
        ax.imshow(im)
        ax.set_xticklabels([])
        ax.set_yticklabels([])

plt.show()

Answer 3

按照 ImportanceOfBeingErnest 的回答，但如果您想使用 plt.subplots 及其功能：

fig, axes = plt.subplots(
    nrow, ncol,
    gridspec_kw=dict(wspace=0.0, hspace=0.0,
                     top=1. - 0.5 / (nrow + 1), bottom=0.5 / (nrow + 1),
                     left=0.5 / (ncol + 1), right=1 - 0.5 / (ncol + 1)),
    figsize=(ncol + 1, nrow + 1),
    sharey='row', sharex='col', #  optionally
)