安装 Julia 后出现 pyplot 错误答案

【问题标题】：pyplot error after installing julia安装 Julia 后出现 pyplot 错误
【发布时间】：2015-01-15 01:51:39
【问题描述】：

将 julia v0.3.2 安装到 MacOSX 10.9.5 没有

Pkg.add("IJulia")
Pkg.add("PyPlot")

使用以下命令启动 ijulia：

ipython notebook --profile=julia

这会启动一个 IJulia 笔记本（它在左上角显示 IJ。

我使用 pyplot 进入 iJulia 的第一行，按 shift enter，然后得到：

objc[21233]：TKApplication 类在 /Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 和 /System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 中实现。将使用两者之一。哪一个是未定义的。 objc[21233]：TKMenu 类在 /Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 和 /System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 中实现。将使用两者之一。哪一个是未定义的。 objc[21233]：TKContentView 类在 /Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 和 /System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 中实现。将使用两者之一。哪一个是未定义的。 objc[21233]：TKWindow 类在 /Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 和 /System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Tk 中实现。将使用两者之一。哪一个是未定义的。信息：正在加载帮助数据... 警告：要求“pyplot”没有定义相应的模块。

好的，所以我的 mac 已经在两个地方安装了 tk 包。如果我从库/框架中删除 TK 和 TCL 框架，如下所示： http://michaelwelburn.com/2013/06/07/python-error-conflicting-tk-libraries-and-activetcl/ 和这里： Python tk framework 然后当我尝试启动 iJulia 时出现以下错误：

信息：正在加载帮助数据... 警告：要求“pyplot”没有定义相应的模块。

其他作者说这有效，所以我很困惑。

我的 /usr/local/bin 目录包括这些）可执行文件： tclselect tclsh tclsh8.5 tclsh8.6 tclvfse 希望wish8.5wish8.6

我犹豫要不要删除系统框架。我有本机 mac python 以及 anaconda 版本（它有自己的 lib/tk）我对下一步感到茫然。

编辑：我的 julia 代码是这样的：

using PyPlot

# julia set
# (the familiar mandelbrot set is obtained by setting c==z initially)
function julia(z, c; maxiter=200)
    for n = 1:maxiter
        if abs2(z) > 4
            return n-1
        end
        z = z*z + c
    end
    return maxiter
end

# varying the second argument to julia() tiny amounts results in a stunning variety of forms
@time m = [ uint8(julia(complex(r,i), complex(-.06,.67))) for i=1:-.002:-1, r=-1.5:.002:1.5 ];

# the notebook is able to display ColorMaps
get_cmap("RdGy")

imshow(m, cmap="RdGy", extent=[-1.5,1.5,-1,1])

iJulia 中的每一行都可以正常执行，除了最后一行以 imshow 开头的会出现此错误：

PyError (PyObject_Call) <class '_tkinter.TclError'>
TclError('Can\'t find a usable tk.tcl in the following directories: \n    /System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Resources/Scripts\n\n/System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Resources/Scripts/tk.tcl: version conflict for package "Tk": have 8.5.15, need exactly 8.5.9\nversion conflict for package "Tk": have 8.5.15, need exactly 8.5.9\n    while executing\n"package require -exact Tk  8.5.9"\n    (file "/System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Resources/Scripts/tk.tcl" line 20)\n    invoked from within\n"source /System/Library/Frameworks/Tk.framework/Versions/8.5/Resources/Scripts/tk.tcl"\n    ("uplevel" body line 1)\n    invoked from within\n"uplevel #0 [list source $file]"\n\n\nThis probably means that tk wasn\'t installed properly.\n',)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/matplotlib/pyplot.py", line 2370, in imshow
    ax = gca()
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/matplotlib/pyplot.py", line 701, in gca
    ax =  gcf().gca(**kwargs)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/matplotlib/pyplot.py", line 343, in figure
    **kwargs)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 80, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-tk/Tkinter.py", line 1764, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)

while loading In[7], in expression starting on line 1

 in pyerr_check at /Users/userme/.julia/v0.3/PyCall/src/exception.jl:58
 in pycall at /Users/userme/.julia/v0.3/PyCall/src/PyCall.jl:85
 in imshow at /Users/userme/.julia/v0.3/PyPlot/src/PyPlot.jl:370

【问题讨论】：

首先，我没有看到任何错误，只有警告（和 INFO 消息）。除了这些警告还有实际问题吗？
您的 IPython 是安装到本机 Mac Python 还是 Anaconda 上？
另外，除了原生 Mac 和 Anaconda 之外，您是否还有第三个 Tk（来自 ActiveTcl 或其他地方）？如果是这样，您是如何安装的？
最后，你试过tclselect 8.6吗？我不知道你运行的哪个 Python 是否关心这一点，但如果是的话，听起来你只有一个 8.6，而你有两个或三个 8.5...
我的python安装到anaconda，我的版本是2.3.1---我没有其他python安装。

标签： python matplotlib julia

【解决方案1】：

我觉得自己好傻。我的问题是我有这些行的 .bash_profile

PATH="/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin:${PATH}"
export PATH

以前的 python 安装遗留下来的。我的 /usr/local/bin 文件夹中还有一堆来自这个旧 python 安装的可执行文件。当我在放入anaconda之前删除了python 2.7文件夹时，我忘了删除这些。

现在错误消失了。我希望这对某人有所帮助。

【讨论】：

【解决方案2】：

对于警告： Warning: requiring "*" did not define a corresponding module. 在某些情况下，检查我们是否使用稳定版本会有所帮助。

在 0.38+pre-versions 中遇到了同样的问题。切换回 0.37 stable 后，问题就消失了。

使用 PyCall 遇到这个问题： Warning: requiring "PyCall" did not define a corresponding module.

【讨论】：