如何将 numpy.savetxt 与包含数组的结构化数组一起使用

Question

假设我有一个结构化数组，如下所示：

a = np.zeros(10,dtype=[('label1',np.int32, 4), ('label2', np.float_)])

我尝试将其保存为 csv 文件：

np.savetxt('output.csv', a, fmt='%d,%d,%d,%d,%f')

Python 会产生这个错误：

ValueError: fmt has wrong number of % formats:  %d,%d,%d,%d,%f

我无法创建适合我的输出的 fmt 字符串。 %s 在这里对我不起作用，因为我需要能够指定浮点数的格式。

是否可以从这种类型的结构化数组创建 csv 文件？

Answer 1

本质上savetxt 所做的是：

for row in arr:
    print(fmt % tuple(row))

所以fmt 必须与row 一起使用，或者在这种情况下，是您数组的一个元素。

In [330]: a = np.zeros(10,dtype=[('label1',np.int32, 4), ('label2', np.float_)])
     ...: 
In [331]: a
Out[331]: 
array([([0, 0, 0, 0],  0.), ([0, 0, 0, 0],  0.), ([0, 0, 0, 0],  0.),
       ([0, 0, 0, 0],  0.), ([0, 0, 0, 0],  0.), ([0, 0, 0, 0],  0.),
       ([0, 0, 0, 0],  0.), ([0, 0, 0, 0],  0.), ([0, 0, 0, 0],  0.),
       ([0, 0, 0, 0],  0.)], 
      dtype=[('label1', '<i4', (4,)), ('label2', '<f8')])
In [332]: a[0]
Out[332]: ([0, 0, 0, 0],  0.)
In [333]: tuple(a[0])
Out[333]: (array([0, 0, 0, 0]), 0.0)

将 4 个 int 嵌套在 label1 中，很难找到一种有效的格式。问题在于如何进行 Python '%' 格式化。

In [334]: '%s, %f'%_
Out[334]: '[0 0 0 0], 0.000000'

如果a 是 5 个字段会更容易

In [335]: a = np.zeros(10,dtype='i,i,i,i,f')
In [336]: a
Out[336]: 
array([(0, 0, 0, 0,  0.),....
       (0, 0, 0, 0,  0.)], 
      dtype=[('f0', '<i4'), ('f1', '<i4'), ('f2', '<i4'), ('f3', '<i4'), ('f4', '<f4')])
In [337]: tuple(a[0])
Out[337]: (0, 0, 0, 0, 0.0)
In [338]: '%d, %d, %d, %d, %f'%tuple(a[0])
Out[338]: '0, 0, 0, 0, 0.000000'

我认为您需要“扁平化”数组的结构，或者编写自定义 savetxt。正如我所指出的，savetxt 并不花哨。如果您可以print 以所需格式逐个元素地排列数组，则可以将该格式写入文件。