如何在 Python 中从大型邻接矩阵创建有向图？

Question

我有一个邻接矩阵，我想清楚地生成一个图形视图（有向图），使用 Python 显示所有节点和边——I found a similar question that was solved in Matlab.

我能够使用Pandas 和Networkx 找到solution，但有一个我无法解决的限制。

请看下面我用来在Jupyter Notebook中生成图表的代码：

%matplotlib inline

import pandas as pd
import networkx as nx
import matplotlib 
import matplotlib.pyplot as plt

mx = pd.read_csv('/Users/student/Desktop/matrix.csv', sep='\t')
G  = nx.DiGraph(mx.values)
nx.draw_networks(G)

这是输出图：

问题：图太小了，因为 x 轴和 y 轴都限制在 1.0，所以我无法清楚地看到所有节点。

我在编写扩展此 matplotlib 图中 axes 范围的脚本时遇到困难？我还想提一下DiGraph() 有ax 参数，它采用Matplotlib Axes object

能帮我解决这个问题吗？

Answer 1

开启

nx.draw_networks(G)

没有参数。在 networkx 文档页面中，有许多不同的方法来绘制图形，使用不同的方法来显示节点和弧线。

网络可能难以可视化，可能需要尝试不同的显示功能才能找到适用于任何给定数据集的功能。