无法保存在 Networkx 和 matplotlib 中制作的图形答案

【问题标题】：Cannot save graph made in Networkx and matplotlib无法保存在 Networkx 和 matplotlib 中制作的图形
【发布时间】：2018-12-06 03:36:18
【问题描述】：

我正在使用 NetworkX 和 matplotlib 以 png 图像作为节点来绘制图形。这是我的代码：

import networkx as nx 
import matplotlib.pyplot as plt 
G = nx.DiGraph()

#DRAWING EDGES ON AXIS 
G.add_edges_from(([1,2],[3,4],[5,6],[7,8]))
pos = nx.circular_layout(G)
fig = plt.figure(figsize=(20, 20)) 
ax = plt.axes([0, 0, 15, 15])
ax.set_aspect('equal') 
nx.draw_networkx_edges(G, pos, ax=ax, arrows=True)

#TRANSFORMING COORDINATES 
trans = ax.transData.transform 
trans2 = fig.transFigure.inverted().transform 

#PUTTING IMAGE INSTEAD OF NODES 
size = 0.2 
p2 = size / 2.0 

for n in G:
   xx, yy = trans(pos[n]) 
   xa, ya = trans2((xx, yy)) 
   a = plt.axes([xa - p2, ya - p2, size, size])
   a.set_aspect('equal')
   a.imshow(image, aspect='auto')
   a.axis('off')

plt.savefig('save.png') 
plt.show()

Jupyter notebook 显示图表。但是，当我使用 Pycharm 时，它显示空白的白色图形。通过 plt.savefig() 保存也不起作用。我尝试在 plt.savefig() 中使用 dpi 但没有改变任何东西。将非常感谢任何线索。

【问题讨论】：

你能重新格式化你的代码吗？缩进 4 个空格告诉 stackoverflow 它是代码。有 '>' 告诉 stackoverflow 它是一个引号。

标签： python matplotlib networkx

【解决方案1】：

在保存的同时添加bbox_inches='tight'解决了这个问题：

plt.savefig('save.png',bbox_inches='tight')

此参数会减少输出图像周围不必要的空白边距。没有它，只能保存整个图形的一部分。

关于如何在 matplotlib 中保存纯图像的有价值的讨论在这里： scipy: savefig without frames, axes, only content

您可以在轴内找到图像的 bbox（使用 get_window_extent)，并使用 bbox_inches 参数仅保存图像的那部分

【讨论】：

【解决方案2】：

我以前也遇到过类似的情况。你能试试这个吗：

import matplotlib 
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

【讨论】：

谢谢jdv，我试过了，但没有任何改变。显示图表也不是那么重要，对我来说至关重要的是保存它。
@ElaSz 我没有提供这个答案。为了清楚起见，我只是对其进行了编辑。如果它不能解决您的问题，您可以忽略它或投反对票。

【解决方案3】：

plt.axes 需要一个矩形，其坐标表示为图形画布的一部分。给定figsize=(20,20)，

ax = plt.axes([0, 0, 15, 15])

应该是

ax = plt.axes([0, 0, 0.75, 0.75])

【讨论】：